基于转录组测序的海巴戟果实中乙烯调控相关基因表达分析

发布时间：2023-02-07 15:24

　　【目的】为了明确乙烯相关基因在海巴戟(Morinda citrifolia L.)果实采后后熟过程中的功能。【方法】以刚采摘的成熟海巴戟果实(0 d)和室温(25℃)后熟2 d的海巴戟果实为研究对象,通过转录组测序(RNA-Seq)和实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR),分析海巴戟果实的转录组数据、乙烯相关基因及其表达水平。【结果】海巴戟果实转录组经组装获得35 721个转录本,26 202个注释基因,筛选后获得3 754个差异基因(P≤0.05,LogFC≥2)。从差异基因中随机选取10个上调基因和10个下调基因进行荧光定量验证,结果表明转录组测序结果可靠。在乙烯合成途径和乙烯信号转导通路中发现4个乙烯合成相关基因-metK、ACS10、ACS12、ACO5和7个乙烯信号转导相关基因-ETR、CTR1、MAPK6、EIN2、EIN3、EBF1、ERF1,这11个基因在乙烯合成途径和乙烯信号转导通路中表达量较高且差异显著,选取其中表达量较高的metK、ACO5、EIN3和EBF1共4个基因进行荧光定量,进一步明确了这4个基因在海巴戟果实后熟过程中的重要作用。【结论】在乙烯合成途径和...

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 试验材料
    1.2 总RNA提取、文库构建及测序
    1.3 表达差异分析
    1.4 荧光定量验证转录组
2 结果与分析
    2.1 测序与拼接组装
    2.2 转录组功能注释
    2.3 转录组差异表达基因聚类分析
    2.4 差异基因GO和KEGG显著富集分析
    2.5 乙烯的生物合成与信号转导途径分析
    2.6 候选基因荧光定量表达分析
    2.7 荧光定量验证转录组
3 讨论与结论



本文编号：3737067