盐胁迫下蚕豆萌发期转录组及LEA基因家族分析
发布时间:2023-03-06 13:12
蚕豆(Vicia faba L.)是一种重要的食用豆类作物。由于蚕豆种子萌发期对盐分较为敏感,同时萌发期又是植物整个生长过程的起始,使得土壤中盐分的累积严重限制了蚕豆的生产。因此提高在种子萌发阶段的耐盐性,是蚕豆育种的最佳改良策略。为了研究盐胁迫下种子萌发阶段的基因动态表达,使用RNA-seq方法研究了两种在萌发期具有不同耐盐性的蚕豆品种的全基因组转录谱。通过比较耐盐性品种Y134和盐度敏感型品种Y078的基因表达差异,共鉴定出4486个差异基因(DEG)。其中,有1410个候选DEG被鉴定为盐胁迫反应基因。此外,在盐处理下16和24小时的种子发芽过程中,有623个DEG被鉴定为品种特异性应答基因。这些DEG中一些参与细胞壁的松动(例如,木葡聚糖内切葡糖苷酶/水解酶,几丁质酶和弹性蛋白),激素代谢(例如,LEA基因,与ABA或乙烯信号通路相关的基因),染色质重塑(例如,染色质结构蛋白,LHP1)等在盐处理的耐盐品种中显着上调,表明它们在盐胁迫下种子萌发调控中起关键作用。结果表明,大量基因可调节蚕豆对盐分的响应,其调控机制较为复杂。根据盐胁迫下蚕豆种子萌发期的转录组(RNA-seq)数据...
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
第一章 文献综述
1.1 盐胁迫研究现状及响应机制
1.2 种子萌发
1.3 种子萌发调控
1.4 盐胁迫下种子萌发期研究进展
1.5 蚕豆盐胁迫研究进展
1.6 转录组技术的应用
1.7 LEA蛋白研究进展
1.8 研究的目的和意义
第二章 转录组分析
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.3 结果与分析
2.4 讨论
第三章 基于蚕豆转录组数据的LEA基因家族分析
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.3 结果与分析
3.4 讨论
第四章 全文结论
致谢
参考文献
附表
个人简介
本文编号:3757050
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
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摘要
abstract
第一章 文献综述
1.1 盐胁迫研究现状及响应机制
1.2 种子萌发
1.3 种子萌发调控
1.4 盐胁迫下种子萌发期研究进展
1.5 蚕豆盐胁迫研究进展
1.6 转录组技术的应用
1.7 LEA蛋白研究进展
1.8 研究的目的和意义
第二章 转录组分析
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.3 结果与分析
2.4 讨论
第三章 基于蚕豆转录组数据的LEA基因家族分析
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.3 结果与分析
3.4 讨论
第四章 全文结论
致谢
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本文编号:3757050
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