海岛棉5个CBF/DREB基因的克隆与表达分析

发布时间：2023-04-15 14:26

　　低温、干旱和盐渍是影响作物生长、产量和全球地理分布的重要非生物胁迫。CBF/DREB转录因子是参与植物非生物胁迫应答反应的重要调控蛋白。为了更好地了解棉花CBF家族基因,通过生物信息学的方法,从海岛棉中克隆了5个具有完整开放阅读框的CBF基因,命名为Gb CBF1―Gb CBF5。这5个基因编码的蛋白与其他植物冷胁迫相关的CBF蛋白具有高度的保守性,含有1个AP2功能结构域和2个特征基序。系统进化树分析表明,这5个基因与拟南芥的3个参与冷胁迫的CBF基因一起聚类在DREB亚家族中的A-1亚组。通过RT-PCR的方法分析了海岛棉基因Gb CBF1―5在高盐(200 mmol·L-1 Na Cl)、干旱、4℃低温等非生物胁迫处理下的表达模式。结果表明其中2个基因在冷胁迫下上调表达,5个基因在干旱和盐处理下均下调表达。这些为进一步探索CBF基因在棉花逆境胁迫应激反应中的作用提供了有价值的信息。

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料培养与处理
    1.2 总RNA的提取和c DNA的制备
    1.3 棉花CBF基因的克隆
    1.4 棉花Gb CBF基因的生物信息学分析
    1.5 棉花Gb CBF基因的半定量RT-PCR
2 结果与分析
    2.1 5 个Gb CBF基因的克隆与序列分析
    2.2 5 个Gb CBF基因编码的氨基酸序列比对分析
    2.3 与陆地棉CBF同源基因的比对结果
    2.4 5 个棉花Gb CBF蛋白的系统进化树分析
    2.5 5 个Gb CBF基因编码蛋白的三级结构预测
    2.6 非生物胁迫处理下5 个Gb CBF基因的表达谱分析
3 讨论与结论



本文编号：3791019