高粱LOX基因家族全基因组鉴定及表达模式分析

发布时间：2023-04-27 01:45

　　利用生物信息学技术鉴定高粱脂氧合酶(LOX)家族基因,并对其进化关系、基因结构、保守基序、不同组织及低温胁迫下的表达模式等进行分析,以此为高粱LOX基因的功能研究奠定基础。结果表明,共鉴定出11条高粱LOX家族基因,根据其染色体位置命名为SbLOX1—SbLOX11,该家族基因可分为2个亚族(9-LOX、13-LOX)且同一亚族基因结构基本相似。表达分析发现,不同基因家族成员在不同组织部位的表达模式各不相同,SbLOX10和SbLOX9基因在各个组织部位中表达量均较低,SbLOX2—SbLOX5、SbLOX8在各个组织部位中表达量均较高。对低温(4℃)处理下高粱LOX基因转录组数据进行分析发现,耐冷型高粱9-LOX亚族中的SbLOX1、SbLOX3、SbLOX5和13-LOX亚族中的SbLOX4、SbLOX9在大多时间点均呈上调表达,且在冷敏感材料中表达量也较高,推测LOX基因在低温胁迫响应中具有重要作用。

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 高粱LOX家族基因的鉴定及理化性质分析
    1.2 高粱LOX家族基因系统进化分析
    1.3 高粱LOX家族基因结构、保守基序(Motif)及二级结构预测
    1.4 高粱LOX家族基因表达模式分析
    1.5 低温处理高粱幼苗转录组学分析
2 结果与分析
    2.1 高粱LOX家族基因的鉴定、理化性质及染色体定位分析
    2.2 高粱LOX基因家族成员系统进化分析
    2.3 高粱LOX家族基因结构及蛋白保守基序分析
    2.4 高粱LOX家族蛋白的结构预测
    2.5 高粱LOX家族基因的表达分析
        2.5.1 不同生长发育时期组织中的表达
        2.5.2 低温胁迫下的表达
3 结论与讨论



本文编号：3802615