花鲈b2m基因cDNA的克隆及表达分析
发布时间:2023-05-04 04:19
为探究花鲈(Lateolabrax maculatus) b2m (Beta-2 microglobulin)基因对细菌和病毒感染的响应,该研究通过RACE-PCR扩增获得了花鲈b2m基因,该基因cDNA全长为1 383 bp,开放阅读框(Open reading frame, ORF)为357 bp,编码118个氨基酸。所推测的编码蛋白与已报道的鱼类B2m的氨基酸序列相似度为44.8%~63.2%。基因共线性分析显示,b2m基因座位置在鱼类基因组中高度保守。利用实时荧光定量PCR检测花鲈b2m基因在各组织器官中的分布,结果表明花鲈b2m在所检测组织器官中均有表达,脾脏中表达量最高,鳃、头肾和脑中次之。通过腹腔注射脂多糖(Lipopolysaccharide, LPS)、聚肌苷-脱氧胞苷酸(Poly I:C)和迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda, Edw)研究花鲈感染后b2m的表达变化,结果显示3种刺激物均可诱导花鲈b2m在鳃、肠、头肾、脾脏组织中表达上调,推测b2m基因参与了花鲈抗细菌、抗病毒感染的免疫应答过程。
【文章页数】:10 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 总RNA提取与cDNA合成
1.2 花鲈b2m cDNA全长序列的扩增
1.3 生物信息学分析
1.4 b2m基因的表达模式分析
1.5 Poly (I:C)、LPS及迟缓爱德华氏菌人工感染对花鲈b2m表达的调节
2 结果
2.1 花鲈b2m的cDNA序列特征
2.2 氨基酸序列比对和分子系统发育分析
2.3 B2m三级结构的预测
2.4 b2m基因结构及共线性分析
2.5 花鲈b2m基因的组织表达模式分析
2.6 花鲈腹腔注射LPS、Poly (I:C)和Edw其b2m基因的表达状况
3讨论
本文编号:3807935
【文章页数】:10 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 总RNA提取与cDNA合成
1.2 花鲈b2m cDNA全长序列的扩增
1.3 生物信息学分析
1.4 b2m基因的表达模式分析
1.5 Poly (I:C)、LPS及迟缓爱德华氏菌人工感染对花鲈b2m表达的调节
2 结果
2.1 花鲈b2m的cDNA序列特征
2.2 氨基酸序列比对和分子系统发育分析
2.3 B2m三级结构的预测
2.4 b2m基因结构及共线性分析
2.5 花鲈b2m基因的组织表达模式分析
2.6 花鲈腹腔注射LPS、Poly (I:C)和Edw其b2m基因的表达状况
3讨论
本文编号:3807935
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