基于线粒体DNA tRNA leu C OⅡ序列的川西地区东方蜜蜂保护遗传学研究
发布时间:2023-05-10 17:50
东方蜜蜂(Apis cerana)在分类学上属昆虫纲(Insecta)、膜翅目(Hymenoptera)、蜜蜂科(Apidae)、蜜蜂属(Apis)。我国境内除新疆以外,大部分地区都有东方蜜蜂的分布,但是受到西方蜜蜂(Apis melliffera)以及人类活动的影响,我国东方蜜蜂的分布范围和种群数量明显减少,遗传资源破坏较严重。目前,四川省已成为我国东方蜜蜂主要分布区之一。本研究选取了四川省23个地理种群411个东方蜜蜂个体,利用线粒体DNA tRNAleuCOⅡ片段序列作为分子标记,对东方蜜蜂的遗传多样性、遗传结构、种群历史动态等方面进行分析,主要研究结果如下:试验成功扩增出长度为436 bp的东方蜜蜂mtDNA tRNAleuCOⅡ基因片段,该段序列A+T的平均含量为85.10%,C+G的平均含量为14.91%,说明此段为A+T富集区;该段序列共存在58个变异位点,包括26个简约信息位点,27个单突变位点和5个碱基缺失位点,共定义了53个单倍型。对23个地理种群进行遗传多样性分析,发现平均核苷...
【文章页数】:79 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
1 文献综述
1.1 东方蜜蜂概述
1.1.1 分类地位
1.1.2 分布范围与亚种分类
1.1.3 遗传资源状况
1.1.4 生存现状
1.2 蜜蜂保护遗传学研究概述
1.2.1 保护遗传学诞生及研究内容
1.2.2 保护遗传学的研究方法
1.2.3 蜜蜂保护遗传学研究概况
1.3 本研究的目的和意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 样品采集
2.1.2 主要试剂
2.1.3 主要仪器设备
2.2 试验方法
2.2.1 基因组DNA提取
2.2.2 样品DNA溶液浓度检测
2.2.3 序列扩增与测序
2.3 数据分析
2.3.1 遗传多样性
2.3.2 遗传分化与种群结构
2.3.3 系统进化发育分析
2.3.4 种群动态研究
3 结果
3.1 东方蜜蜂DNA提取和PCR扩增
3.1.1 东方蜜蜂DNA提取结果
3.1.2 东方蜜蜂线粒体DNA扩增结果
3.2 遗传多样性
3.2.1 碱基组成
3.2.2 多态信息位点
3.2.3 单倍型分析
3.2.4 核苷酸多态性分析
3.2.5 核苷酸差异分析
3.3 遗传分化与种群结构
3.3.1 遗传距离分析
3.3.2 种群间的遗传分化与基因流
3.3.3 分子变异分析(AMOVA)
3.4 系统进化树
3.4.1 单倍型之间的系统地理关系
3.4.2 单倍型与全国的系统地理关系
3.5 单倍型网络中介图
3.6 种群进化历史动态分析
3.6.1 中性检验
3.6.2 歧点分布
4 讨论
4.1 东方蜜蜂DNA tRNAleu
COⅡ基因片段讨论
4.2 遗传多样性讨论
4.3 种群间的遗传分化与亲缘关系讨论
4.4 种群遗传结构划分
4.5 系统地理格局形成
4.6 阿坝州和甘孜州东方蜜蜂的探讨
4.7 种质资源的保护
4.8 遗传管理单元的划分及保护建议
5 结论
参考文献
致谢
作者简历
本文编号:3813218
【文章页数】:79 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
1 文献综述
1.1 东方蜜蜂概述
1.1.1 分类地位
1.1.2 分布范围与亚种分类
1.1.3 遗传资源状况
1.1.4 生存现状
1.2 蜜蜂保护遗传学研究概述
1.2.1 保护遗传学诞生及研究内容
1.2.2 保护遗传学的研究方法
1.2.3 蜜蜂保护遗传学研究概况
1.3 本研究的目的和意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 样品采集
2.1.2 主要试剂
2.1.3 主要仪器设备
2.2 试验方法
2.2.1 基因组DNA提取
2.2.2 样品DNA溶液浓度检测
2.2.3 序列扩增与测序
2.3 数据分析
2.3.1 遗传多样性
2.3.2 遗传分化与种群结构
2.3.3 系统进化发育分析
2.3.4 种群动态研究
3 结果
3.1 东方蜜蜂DNA提取和PCR扩增
3.1.1 东方蜜蜂DNA提取结果
3.1.2 东方蜜蜂线粒体DNA扩增结果
3.2 遗传多样性
3.2.1 碱基组成
3.2.2 多态信息位点
3.2.3 单倍型分析
3.2.4 核苷酸多态性分析
3.2.5 核苷酸差异分析
3.3 遗传分化与种群结构
3.3.1 遗传距离分析
3.3.2 种群间的遗传分化与基因流
3.3.3 分子变异分析(AMOVA)
3.4 系统进化树
3.4.1 单倍型之间的系统地理关系
3.4.2 单倍型与全国的系统地理关系
3.5 单倍型网络中介图
3.6 种群进化历史动态分析
3.6.1 中性检验
3.6.2 歧点分布
4 讨论
4.1 东方蜜蜂DNA tRNAleu
COⅡ基因片段讨论
4.2 遗传多样性讨论
4.3 种群间的遗传分化与亲缘关系讨论
4.4 种群遗传结构划分
4.5 系统地理格局形成
4.6 阿坝州和甘孜州东方蜜蜂的探讨
4.7 种质资源的保护
4.8 遗传管理单元的划分及保护建议
5 结论
参考文献
致谢
作者简历
本文编号:3813218
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3813218.html
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