甘薯花青素合成酶（ANS）基因的克隆及其组织表达模式分析

发布时间：2023-05-10 23:29

　　从NCBI数据库中检索得到甘薯ANS序列,利用同源比对在前期转录组数据库中筛选获得同源序列,通过PCR反应克隆出甘薯ANS基因(IbANS)的c DNA全长序列,进而预测和分析IbANS基因的蛋白质序列,同时对其在不同甘薯品种的不同组织进行了实时定量PCR分析。结果表明,该c DNA具有最大开放阅读框(ORF),共1 086个碱基,编码362个氨基酸残基;ANS蛋白为亲水性蛋白质,不存在信号肽;保守结构域预测分析表明,该基因编码的蛋白具有典型的ANS蛋白功能结构域,属于2OG-Fe II_Oxy双加氧酶超家族;系统进化树分析显示,甘薯ANS与三浅裂野牵牛亲缘关系最近;荧光定量PCR结果表明,IbANS在紫心甘薯块根中高表达。研究结果可为进一步阐明IbANS基因在紫心甘薯块根中的形成及累积机制提供理论基础。

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料
        1.1.1 植物材料
        1.1.2 仪器
        1.1.3试剂
    1.2 方法
        1.2.1 总RNA的提取和c DNA的反转录
        1.2.2 甘薯ANS基因c DNA的获得
        1.2.3 生物信息学分析
        1.2.4 实时荧光定量PCR检测
    1.3 数据分析
2 结果与分析
    2.1 甘薯Ib ANS基因克隆与电泳检测
    2.2 理化性质分析结果
    2.3 亲/疏水性分析结果
    2.4 蛋白跨膜结构域及保守结构域分析
    2.5 蛋白信号肽预测
    2.6 亚细胞定位预测
    2.7 蛋白质二级结构预测
    2.8 蛋白质三级结构预测
    2.9 系统进化树分析
    2.1 0 实时荧光定量PCR检测ANS基因的组织表达结果
3 结论与讨论



本文编号：3813710