基于线粒体COI基因的雷州半岛马尾藻属常见种DNA条形码鉴定及系统进化分析

发布时间：2023-06-03 19:38

　　采用DNA条形码技术辅以传统形态分类方法,对雷州半岛马尾藻属(Sargassum)6常见种进行物种鉴定和系统进化分析。测得6种马尾藻线粒体COI基因序列,该序列与Gen Bank和BOLD数据库中马尾藻序列同源性均大于或等于99%,该结果与形态分类学鉴定结果一致。COI基因序列特征分析表明,6种马尾藻保守位点421个,变异位点58个,简约信息位点21个,单一突变位点37个,变异率7.7%,T、C、A、G平均含量分别为39.1%、18.9%、19.1%、22.9%,A+T含量(58.2%)高于C+G含量(41.8%),UUU所编码的苯丙氨酸(F)使用频率最高,达12.5%,最大似然法估算的转换颠换比值为2.42,种间遗传距离多在0.030±0.013⁰.100±0.016之间。聚类分析结果与形态学鉴定、同源性分析结果一致。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料采集
    1.2 形态学分类
    1.3 分子生物学鉴定
        1.3.1 基因组DNA提取
        1.3.2 mt DNA-COI序列PCR扩增与测序
        1.3.3 数据分析
2 结果与分析
    2.1 形态学分类与分子鉴定
    2.2 线粒体COI基因片段序列特征分析
    2.3 遗传距离
    2.4 聚类分析
3 讨论



本文编号：3829916