一个A亚族铁皮石斛蛋白磷酸酶2C基因的分子特征研究

发布时间：2023-06-13 22:39

　　目的克隆珍稀濒危兰科药用植物铁皮石斛蛋白磷酸酶(protein phosphatase,PP)基因DoPP2C2并进行生物信息学和表达模式分析。方法采用RACE和RT-PCR获基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 7.0和MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助定量PCR检测基因表达模式。结果分离到DoPP2C2基因(Gen Bank注册号KT957553),cDNA全长1 624 bp,编码一条由387个氨基酸组成的多肽,相对分子质量42.76×10³,等电点7.03; DoPP2C2蛋白具有植物PP2Cs蛋白家族保守的2个蛋白磷酸酶结构域(91～152、216～376);该蛋白无信号肽或跨膜域,定位在细胞核,系亲水性蛋白; DoPP2C2蛋白与多种植物PP2C蛋白一致性较高(47.8%～73.4%); DoPP2C2隶属于拟南芥和水稻PP2C蛋白家族进化树的A亚族,与OsPP2C30亲缘关系较近; DoPP2C2基因表达有器官差异,根和茎中相对表达量为叶的0.76和0.59倍。结论获...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料和取样
    1.2 RNA提取和c DNA合成
    1.3 RACE与RT-PCR验证
    1.4 生物信息学分析
    1.5 实时定量PCR分析
2 结果与分析
    2.1 Do PP2C2基因的克隆分析
    2.2 Do PP2C2蛋白的理化特性
    2.3 Do PP2C2蛋白结构域、二级结构和三维建模分析
    2.4 Do PP2C2蛋白信号肽、跨膜域和定位预测分析
    2.5 Do PP2C2和植物PP2C蛋白的多序列对比分析
    2.6 Do PP2C2的分子进化树构建分析
    2.7 Do PP2C2基因的表达模式分析
3 讨论



本文编号：3833439