茶树CsDREB-A2转录因子基因的克隆与非生物胁迫响应分析
发布时间:2023-10-04 02:25
干旱应答元件结合蛋白(DREB)类转录因子在植物逆境信号转导途径中具有重要的调控作用。为了解AP2/ERF转录因子在茶树逆境胁迫的分子调控机理,本研究从茶树龙井43叶片的cDNA中克隆得到一个编码CsDREB-A2转录因子的基因;对CsDREB-A2基因及其编码蛋白序列特征进行分析,并利用实时荧光定量PCR法检测该基因在茶树不同非生物胁迫处理下的表达水平。结果表明,CsDREB-A2基因开放阅读框为1 056 bp,编码351个氨基酸,其编码氨基酸序列具有AP2保守结构域,包含典型的YRG元件和WLG基序。AP2结构域第14、第19位氨基酸分别为缬氨酸和谷氨酸。拟南芥AP2/ERF家族转录因子的进化分析表明,该转录因子属于DREB亚族的A2组。CsDREB-A2相对分子质量为39 080 Da,理论等电点为5.32,属于亲水性蛋白,主要由α-螺旋和随机卷曲组成,无序化特征明显且存在一个LM无序区域;可能定位于细胞核,不存在信号肽和跨膜结构,属于非分泌蛋白。CsDREB-A2基因在高温(38℃)和干旱(200 g·L-1 PEG)胁迫下均能快速诱导表达,并显著高于对...
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试验材料及处理
1.2 试验方法
1.2.1 总RNA提取和cDNA合成
1.2.2 CsDREB-A2基因的克隆
1.2.3 生物信息学分析
1.2.4 茶树CsDREB-A2基因的表达特性分析
2 结果与分析
2.1 茶树CsDREB-A2基因的克隆
2.2 茶树CsDREB-A2转录因子进化树分析
2.3 茶树CsDREB-A2转录因子与其他植物相关氨基酸序列比对
2.4 茶树CsDREB-A2转录因子氨基酸组成及理化性质分析
2.5 茶树CsDREB-A2蛋白亚细胞定位预测
2.6 茶树CsDREB-A2蛋白氨基酸亲、疏水性和无序化分析
2.7 茶树CsDREB-A2转录因子信号肽、跨膜结构预测与分析
2.8 茶树CsDREB-A2蛋白推导的二级和三级结构预测与分析
2.9 茶树CsDREB-A2基因在非生物胁迫下的表达情况
3 讨论
4 结论
本文编号:3851125
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试验材料及处理
1.2 试验方法
1.2.1 总RNA提取和cDNA合成
1.2.2 CsDREB-A2基因的克隆
1.2.3 生物信息学分析
1.2.4 茶树CsDREB-A2基因的表达特性分析
2 结果与分析
2.1 茶树CsDREB-A2基因的克隆
2.2 茶树CsDREB-A2转录因子进化树分析
2.3 茶树CsDREB-A2转录因子与其他植物相关氨基酸序列比对
2.4 茶树CsDREB-A2转录因子氨基酸组成及理化性质分析
2.5 茶树CsDREB-A2蛋白亚细胞定位预测
2.6 茶树CsDREB-A2蛋白氨基酸亲、疏水性和无序化分析
2.7 茶树CsDREB-A2转录因子信号肽、跨膜结构预测与分析
2.8 茶树CsDREB-A2蛋白推导的二级和三级结构预测与分析
2.9 茶树CsDREB-A2基因在非生物胁迫下的表达情况
3 讨论
4 结论
本文编号:3851125
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3851125.html
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