PLA3基因生物信息学分析及在赤霉素调控水稻种子萌发中的作用

发布时间：2024-01-25 14:43

　　水稻(Oryza sativa) PLA3基因编码谷氨酸羧肽酶,影响种子萌发等生长发育过程。本研究运用CRISPRCas9技术获得‘日本晴’水稻pla3突变体,该突变体具有胚变大、易萌发的表型。通过对PLA3蛋白进行多物种同源比对和进化分析,发现其具有较高的保守性。对PLA3基因的时空表达和响应不同激素的表达进行了分析,发现其在胚中表达较高,并受赤霉素(GA)等诱导。同时对PLA3蛋白的亚细胞定位、种子萌发过程中GA的含量及转录组学差异等进行分析,结果表明:PLA3定位于内质网;野生型与pla3种子萌发中不同阶段(12和30 h)胚内GA含量差异较大;转录组测序筛选获得与GA信号途径相关的41个差异基因; pla3中信号途径基因如GID2表达出现明显上调。综上所述, PLA3基因与种子萌发相关并参与GA调控种子萌发的过程。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料与试剂
    1.2 生物信息学分析
    1.3 PLA3亚细胞定位实验
    1.4 用LC-MS/MS测定GA含量的方法
    1.5 转录组测序
2 实验结果
    2.1 PLA3基因生物信息学相关分析
        2.1.1 PLA3蛋白系统进化树构建
        2.1.2 PLA3基因时空表达特异性分析
        2.1.3 PLA3基因响应植物激素的表达分析
        2.1.4 PLA3蛋白亚细胞定位
    2.2 PLA3对种子萌发的影响及其与GA的关系
        2.2.1 PLA3对种子萌发的影响
        2.2.2 野生型与pla3种子萌发过程中GA含量的差异比较
        2.2.3 野生型与pla3种子萌发过程中转录组差异基因分析
3 讨论



本文编号：3885007