龙眼DlbZIP21基因克隆与表达分析

发布时间：2024-02-20 21:45

　　【目的】分析bZIP转录因子基因DlbZIP21在石硖和四季蜜两个龙眼品种不同组织和年周期表达水平的差异性,为揭示不同龙眼品种成花差异的分子调控机制提供理论依据。【方法】以石硖和四季蜜龙眼为试材,克隆其DlbZIP21基因,并对其编码蛋白理化性质特性、磷酸化位点和结构域进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR分析该基因的时空表达特征。【结果】克隆获得石硖和四季蜜龙眼DlbZIP21基因分别命名为DlbZIP21-sx和DlbZIP21-sj,其开放阅读框(ORF)均为1353 bp,各编码450个氨基酸残基,预测蛋白质分子量分别为49.80和49.81 kD,理论等电点均为6.53。BLAST比对和系统发育进化树分析结果表明,DlbZIP21-sx与DlbZIP21-sj蛋白的同源性为99.78%,同时与大豆、水稻和菜豆的亲缘关系较近。DlbZIP21基因在花芽中的表达量表现为四季蜜龙眼比石硖龙眼高5倍;在年周期中,从1～12月DlbZIP21基因在四季蜜龙眼中的表达量均普遍高于石硖龙眼,其中在花芽分化期和开花期(12月—翌年4月)的表达量高于石硖龙眼6～8倍。【结论】DlbZIP2...

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【部分图文】：

图1龙眼总RNA(A)和DlbZIP21(B)扩增序列的琼脂糖凝胶电泳检测结果

以NCBI-CDS对2个DlbZIP21蛋白保守结构域进行在线预测,结果(图2)表明,两个DlbZIP21蛋白保守结构域相同,均属于bZIP蛋白超家族[13],具有调节细胞发育功能,该结构包括1个bZIP-HBP-1b结构和1个DOG1结构域,DOG1结构域是一种特殊的植物种子....

图2DlbZIP21编码蛋白的保守功能域

图1龙眼总RNA(A)和DlbZIP21(B)扩增序列的琼脂糖凝胶电泳检测结果2.4DlbZIP21蛋白磷酸化位点分析结果

图3DlbZIP21蛋白磷酸位点预测结果

从图6还可看出,在不同组织中,DlbZIP21基因在2个龙眼品种的果皮和果肉中表达量均偏低,在四季蜜龙眼花芽中的表达量较在石硖龙眼花芽表达量高5倍;在年周期中,从1-12月DlbZIP21基因在两个利用品种中的表达量总体上呈先上升后下降再上升的变化趋势,在四季蜜龙眼中的表达量普遍....

图4DlbZIP21与其他物种bZIP的氨基酸序列比对分析结果

图3DlbZIP21蛋白磷酸位点预测结果图5基于bZIP21氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树

本文编号：3904565