TBX15基因甲基化在肝细胞癌中的表达调控及其功能研究

发布时间：2024-03-21 23:43

　　目的原发性肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,其恶性程度高,潜伏期长,起病隐匿,进展快,病程短,死亡率高,严重威胁着人们的健康和生命。肝癌的发生是一个复杂而渐进的过程。本研究前期通过在线工具MethHC数据库筛选出启动子甲基化显著差异且与其表达水平呈负相关基因,再结合TCGA数据库的肝癌数据对候选基因进行生物信息学整合分析,并探讨该基因与肝癌预后的关系。本次研究将针对候选基因TBX15在肝癌及相应的癌旁组织和HCC细胞系中进行相关基因表达和功能验证,深入研究该基因启动子甲基化对其mRNA表达的调控和细胞肿瘤行为的影响。方法1.生物信息学分析:(1)利用在线工具MethHC数据库筛选肝癌发生发展过程中的启动子甲基化显著差异基因;(2)使用癌症基因组图谱TCGA公共数据库中的HumanMethylation450 BeadChip(Illumina)平台下载Level 1中的甲基化及mRNA数据和临床数据;(3)使用R软件对原始数据进行整合分析,然后对候选基因TBX15在纳入的肝癌及其癌旁组织样本中进行甲基化和mRNA表达差异分析;(4)Spearman等级相关分析TBX15基因启动子甲基化对...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-2TBX15基因启动子甲基化与其mRNA表达相关性散点图

图1-2TBX15基因启动子甲基化与其mRNA表达相关性散点图igure1-2ScatterplotshowingthecorrelationsofTBX15promotermethylatedexpressedlevelsTBX15启动子甲基化与....

图1-3TBX15基因启动子甲基化高和低两组的生存曲线图

图1-3TBX15基因启动子甲基化高和低两组的生存曲线图igure1-3ThesurvivalcurvewithhighandlowmethylationofTBX15promoter研究采用COX比例风险回归模型探讨TBX15基因启动子甲基与....

图1-4TBX15基因的mRNA表达柱状图

图1-4TBX15基因的mRNA表达柱状图gure1-4HistogramplotshowingmRNAexpressedlevelsofTBX，全球每年的肝癌发病率为6.26/10万人口，年来均有升高趋势，其中超过50％的病例来癌的治疗已经有了....

图2-3pcDNA3.1（+）载体图谱

素浓度为100μg/ml），用玻棒缓慢将菌液均匀涂开。等到平板表置，于37℃过夜培养。鉴定挑取上述平板上的单菌落，送测序公司进行测序以及鉴定。构建过表达载体X15基因序列分析根据UCSC基因组生物信息库（http://genome.ucsc.edu/）查找的序列，对....

本文编号：3934310