外胚层发育不良及先天缺牙基因突变分析

发布时间：2024-04-14 00:09

　　研究目的:寻找外胚层发育不良(ectodermal dysplasia,ED)及单纯性先天缺牙(selective tooth agenesis,STA)患者可能致病的基因突变,并对基因突变的致病性进行功能验证。材料与方法:抽取ED及STA患者外周血并提取血液基因组,对基因组DNA进行全外显子测序。对测序结果进行分析,筛选出可能致病的基因突变,并通过细胞功能实验对突变致病性进行验证。结果:对5名ED患者及1名STA患者进行全外显子测序。测序数据分析结果显示,其质量合格满足后续分析要求。对数据进行进一步筛选,在5名ED患者中发现4个EDA基因突变,包括2个移码突变(c.252delT,c.441₄42insACTCT)及2个错义突变(c.463C>T,c.1013C>T)。两个EDA移码突变导致EDA蛋白胞外结构域破坏,细胞无法分泌活性EDA蛋白,进而引起下游NF-κB通路活性异常。EDA c.463C>T突变位于EDA蛋白胞外剪切位点,可导致可溶性EDA分泌减少及NF-κB通路活性降低。EDA c.1013C>T突变也可影响下游NF-κB通...

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【部分图文】：

图3.1ED患者缺牙状况分析

上海交通大学硕士学位论文252/10）及下颌第一磨牙（30%，3/10）。综上所述，本研究中ED患者前磨牙及切牙缺失较为常见，磨牙及尖牙缺失较为少见。表3.2ED患者牙齿缺失状况。Table3.2PatternsofteethlossforEDpatients.“*”缺失牙位图3....

图3.2一名患者全外显子测序原始数据过滤状况

上海交通大学硕士学位论文263.1.2全外显子测序及结果筛选为寻找外胚层发育不良可能致病的基因突变，本研究抽取了五名ED患者的外周静脉血，并进行全外显子测序。原始数据分析结果显示，所有患者测序数据的GC碱基比例均为50%左右：低质量reads（Lowqualityreads）在原....

图3.3一名患者全外显子测序数据碱基分布图

上海交通大学硕士学位论文263.1.2全外显子测序及结果筛选为寻找外胚层发育不良可能致病的基因突变，本研究抽取了五名ED患者的外周静脉血，并进行全外显子测序。原始数据分析结果显示，所有患者测序数据的GC碱基比例均为50%左右：低质量reads（Lowqualityreads）在原....

图3.4一名患者全外显子测序数据碱基质量状况

上海交通大学硕士学位论文27图3.4一名患者全外显子测序数据碱基质量状况。Figure3.4ThebasequalityoftheWESdatafromoneEDpatient.本研究在五名ED患者中均筛选到可能致病的EDA基因突变，包括2个移码突变（EDAc.252delT，E....

本文编号：3953827