影响胃癌总体生存率的免疫相关基因筛选

发布时间：2024-04-20 18:51

　　目的探讨胃癌免疫相关基因与患者预后和临床指标的相关性。方法通过癌症基因组图谱数据库(TCGA)下载胃癌患者的临床信息和基因表达信息,通过免疫相关基因数据库(ImmPort)下载免疫相关基因列表,筛选出差异表达且影响胃癌术后总体生存率的免疫相关基因,然后与临床指标结合通过多因素COX回归分析筛选出独立影响预后的免疫相关基因。研究筛选出来的免疫相关基因与免疫细胞的相关性,以及与肿瘤微环境的相关性,并对筛选的基因进行通路富集分析。结果 NOX4基因(χ²=4.2,P=0.041)、SLC22A17基因(χ²=6.6,P=0.010)、DKK1基因(χ²=7.4,P=0.007)为影响胃癌预后的独立风险基因。在胃癌中NOX4基因、SLC22A17基因与B细胞、CD8⁺T细胞、CD4⁺T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞的浸润量均有相关性(均P<0.05),DKK1基因与CD8⁺T细胞和巨噬细胞的浸润量具有相关性(均P<0.05)。通过肿瘤微环境评分...

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【部分图文】：

图4预后免疫相关基因在正常组织和肿瘤组织的表达量

通过R软件,采用Kruskal-Wallis检验方法对病理分级和病理分期(T、N、M)进行检验。NOX4、SLC22A17、DKK1基因的表达在N分期和M分期中均无统计学差异,因此未绘制图形。如图5所示:在T分期中,随着T分期的进展NOX4基因和SLC22A17基因表达量有逐渐增....

图5预后免疫相关基因与临床病理指标相关性分析

图4预后免疫相关基因在正常组织和肿瘤组织的表达量2.7预后免疫相关基因与免疫细胞浸润量的相关性分析

图6GO、KEGG基因通路富集分析

通过R软件“org.Hs.eg.db”包对影响胃癌术后总体生存率的20个基因进行GO(GeneOntology)通路富集分析和KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)通路富集分析。将20个基因全部纳入后,富集分析分析的通路相对更....

图1临床指标单因素COX回归分析

如图1所示,通过对临床指标进行单因素COX回归分析发现:年龄[HR=1.020,95%CI:1.003～1.037,P=0.019]、T分期[HR=1.369,95%CI:1.102～1.702,P=0.005]、M分期[HR=2.502,95%CI:1.435～4.365,P=....

本文编号：3959826