鳗鲡肠道微生物抗性基因组成特征的初步分析

发布时间：2024-04-27 01:15

　　肠道微生物是抗生素抗性基因(ARGs)的储存库,为明确ARGs在鱼肠道微生物中的组成特征,本研究以养殖鳗鲡为研究对象,利用高通量测序技术及功能宏基因组学分析方法对鳗鲡肠道微生物ARGs的种类和丰度进行了探究。研究结果显示,养殖鳗鲡肠道微生物主要由厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)组成,比对抗性基因数据库共注释得到254种ARGs基因,分别归属于24类抗性类型,其中高丰度的抗性类型为多肽类抗生素、多重耐药、氟喹诺酮类、四环素类和β-内酰胺类。以上结果表明,在鳗鲡养殖过程中,出现耐多肽类抗生素、氟喹诺酮类、四环素类、β-内酰胺类以及多重耐药病原菌的机会相对较高。本研究为抗生素在鳗鲡养殖过程中合理使用提供参考依据,同时也显示宏基因组测序技术在检测鱼肠道ARGs的可行性和优越性。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 主要试剂
    1.3 DNA提取与纯化
    1.4 Illumina测序及高通量数据处理
2 结果与分析
    2.1 高通量测序序列数据分析
    2.2 鳗鲡肠道菌群结构和多样性分析
    2.3 鳗鲡肠道微生物基因组抗性基因分析结果
3 讨论



本文编号：3965139