果生刺盘孢菌转录组分析及致病基因的挖掘

发布时间：2024-04-28 05:13

　　油茶(Camellia oleifera)是我国重要的木本食用油料树种,炭疽病是油茶最主要的病害之一,而果生刺盘孢菌(Colletotrichum fructicola)是该病的优势致病菌。本研究对海南五指山和湖南邵阳的果生刺盘孢菌种群进行了生物学特性和致病力比较,并应用RNA-seq技术分别对两个种群的代表菌株侵染油茶前后的基因表达情况进行分析,旨在从分子水平上明确两个地理种群在侵染后期的代谢过程及其调控基因的异同,有助于理解果生刺盘孢菌的进化机制和致病机制。研究结果如下:(1)生物学特性和菌丝侵染试验结果表明,两个地理种群的菌丝生长速率、产孢量和接种油茶嫩叶96h后产生的病斑数量均无明显差异,但是五指山种群造成的平均病斑直径更大。同一种群内不同菌株间的致病力差异较大,选取各自种群中致病力最强且稳定的菌株作为转录组测序用的供试菌株。(2)分别对两个地理种群代表菌株的分生孢子样品和侵染油茶叶96h后的病斑样品进行转录组测序。孢子组和侵染组样品的clean data平均数据量分别为60M和84M,比对到参考基因组的reads平均数据量分别为53M和17M。邵阳代表菌株筛选出侵染前后差异表...

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【部分图文】：

图２．１邵阳和五指山的果生刺盘孢菌的生长速率与产孢量比较??Ａ：邵阳和五指山果生刺盘孢菌的生长速率；Ｂ：邵阳和五指山果生刺盘孢菌的产孢量??

中南林业科技大学硕士学位论文?果生刺盘孢菌转录组分析及致病基因的挖掘??２．３．２两个种群的菌落生长速率和产孢量比较??为了比较湖南邵阳和海南五指山的果生刺盘孢菌种群的营养生长是否有差异，将??两个种群的菌株均接种于ＰＤＡ平板上培养４ｄ，每个菌株３个重复。结果显示，邵阳??种群的....

图２．２邵阳和五指山果生刺盘孢菌种群对油茶叶片的致病力??Ａ：邵阳和五指山果生刺盘孢菌在油茶叶片上产生的病斑直径；Ｂ：邵阳和五指山果生刺盘孢菌??

中南林业科技大学硕士学位论文?果生刺盘孢菌转录组分析及致病基因的挖掘??统计侵染９６ｈ时病斑的直径，结果如图２．２所示，邵阳种群的病斑平均直径为０．３７ｃｍ，??五指山种群的病斑平均直径为０．５６ｃｍ；同一种群内病斑大小差异较大，邵阳种群和??五指山种群的病斑大小方差分别为０．２....

图２．４邵阳果生刺盘孢菌致病力比较??Ｆｉｇ．２．４?Ｐａｔｈｏｇｅｎｉｃｉｔｙ?ｏｆ?４?Ｃ．ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ?ｓｔｒａｉｎｓ?ｆｒｏｍ?Ｓｈａｏｙａｎｇ??

Ｉ?０．４?－丨丨?叾?ｆ?＿?＿??〇－２－?Ｉ?Ｉ?〇?Ｉ?Ｉ?Ｉ?■??①??图２．３五指山果生刺盘孢菌致病力比较??Ｆｉｇ．２．３?Ｐａｔｈｏｇｅｎｉｃｉｔｙ?ｏｆ?７?Ｃ．ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ?ｓｔｒａｉｎｓ?ｆｒｏｍ?Ｗｕｚｈｉｓｈａｎ??Ｔｈｅ?ｄｏｔｔｅｄ?ｌｉｎ....

图２．３五指山果生刺盘孢菌致病力比较??Ｆｉｇ．２．３?Ｐａｔｈｏｇｅｎｉｃｉｔｙ?ｏｆ?７?Ｃ．ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ?ｓｔｒａｉｎｓ?ｆｒｏｍ?Ｗｕｚｈｉｓｈａｎ??

中南林业科技大学硕士学位论文?果生刺盘孢菌转录组分析及致病基因的挖掘??为０．４５ｃｍ的病斑。４个邵阳来源的果生刺盘孢菌株的致病力差异较大，病斑直径离??散程度Ｓ值为０．２１，其中ＳＹ０１０４ｂ菌株的致病力最为显著，而ＳＹ０２０１ａ的致病力最??弱。??为避免菌株个体差异，选取各....

本文编号：3966217