蓖麻3个PIP基因的克隆与冷胁迫下的表达分析

发布时间：2024-10-17 13:00

　　 植物水通道蛋白参与水分快速跨膜运输、调节植物体内的养分转运、种子萌发、侧根生长等多种生理过程。本研究以蓖麻(Ricinus communis)自交系'通蓖5号'叶片为材料,设计特异性引物,采用RT-PCR技术成功克隆3个水通道蛋白基因的开放阅读框(ORFs),分别命名为蓖麻质膜内源蛋白基因1;3 (Ricinus communis plasma membrane intrinsic proteins genes 1; 3, RcPIP1; 3)(Gen Bank No. MT068547)、RcPIP2; 1(Gen Bank No. MT068546)和RcPIP2;2 (Gen Bank No. MT068545)。生物信息学分析表明3个基因均包含4个外显子和3个内含子,编码蛋白含有6个跨膜螺旋和主要内源蛋白(major intrinsic proteins, MIPs)超家族特有的2个NPA (Asn-Pro-Ala)基序。多重序列比对表明RcPIP1;3与杨树(Populus tremula) Pt PIP1;3的相似性高达92.36%;RcPIP2;1、RcPIP2;2分别与...

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【部分图文】：

图1RcPIP1;3(A)、RcPIP2;1(B)、RcPIP2;2(C)基因的ORFs扩增

PlantCARE在线预测了RcPIP1;3、RcPIP2;1与RcPIP2;2启动子区的顺式作用元件(表2)。预测显示RcPIP1;3、RcPIP2;1与RcPIP2;2均具有响应光照、赤霉素诱导与调控组织生长的顺式作用元件，暗示该基因具有调节生长发育的潜在功能；....

图2RcPIP1;3、RcPIP2;1和RcPIP2;2基因结构分析

图1RcPIP1;3(A)、RcPIP2;1(B)、RcPIP2;2(C)基因的ORFs扩增2.3RcPIP1;3、RcPIP2;1、RcPIP2;2序列及结构分析

图3RcPIP1;3、RcPIP2;1与RcPIP2;2跨膜结构域分析

为探索RcPIP1;3、RcPIP2;1与RcPIP2;2是否响应低温胁迫，本探究采用qRT-PCR的方法检测该基因受冷胁迫(4℃)0、2、6、8h的表达情况(图7)，结果发现，冷处理后RcPIP1;3、RcPIP2;2基因均上调表达，RcPIP2;1下调表达。....

图4RcPIP1;3、RcPIP2;1与RcPIP2;2保守区预测

图3RcPIP1;3、RcPIP2;1与RcPIP2;2跨膜结构域分析3讨论

本文编号：4008040