灰飞虱携带的水稻条纹病毒NS2和NS3基因的分子变异

发布时间：2017-06-15 15:04

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【摘要】：为揭示灰飞虱携带水稻条纹病毒(rice stripe cirus,RSV)的NS2和NS3基因分子变异特征,采用单雌产卵法从江苏、云南、山东、河北等地获得20个灰飞虱携带的RSV分离物,RT-PCR扩增出NS2和NS3基因特异片段,并对扩增产物进行克隆测序,再结合Genbank中已报道的其他分离物序列,利用生物信息学软件分析不同寄主、地区分高物的分子变异特点及系统发育关系。序列测定表明,20个分离物NS2和NS3 2个基因核苷酸序列同源性分别为96.5%~100%(NS2)和95.4%~100%(NS3),推导编码的蛋白氨基酸序列同源性为97.0%~100%(NS2)和96.2%~100%(NS3)。基于核苷酸序列构建的系统进化树分析表明2个基因均可以明显分为2组,其中一组均为中国云南水稻上的分高物,2组间遗传距离分别为0.05711(NS2)和0.06081(NS3),2基因的Z-test的检测结果表明都处于强烈的负选择压下。从2基因氨基酸构建的系统发育树和变异热点上分析,其氨基酸序列的分子变异首先与地缘相关,2基因均可以分成中国云南及云南以外的2个地理亚群;其次与寄主相关,可以划分为灰飞虱和水稻2个寄主群。
【作者单位】： 江苏省农业科学院植物保护研究所;
【关键词】： 水稻条纹病毒 NS和NS基因 分子变异 寄主群 地理亚群
【基金】：国家自然科学基金(31201506) 国家公益性(农业)行业专项(201003031) 江苏省农业科技自主创新项目[CX(13)5026]
【分类号】：S435.11
【正文快照】： 植物病毒的群体遗传结构不仅可为我们追踪病 毒的起源、进化和流行途径提供重要依据,同时其遗传结构及演化机制还直接影响着病毒病害的发生、发展和控制。病毒病的发生和流行是寄主、病毒、介体以及环境等各因子相互作用的结果,各因子相互作用、相互制约形成了一^l''变化的植

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