苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆及其非生物胁迫下的表达分析
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【摘要】:根据苦荞花期转录组数据,采用RT-PCR技术和PCR技术克隆得到一条新的b HLH类蛋白基因FtbHLH3(登录号:KU296217),并分析了逆境胁迫下该基因在芽期苦荞胚轴和子叶中的表达量。结果显示,Ftb HLH3基因cDNA全长1 273 bp,包含一个957 bp的开放阅读框,编码蛋白含318个氨基酸。蛋白结构域分析表明,FtbHLH3编码蛋白N-端和C-端分别含有一个bHLH家族典型的结构域。系统进化树分析表明,FtbHLH3与其它植物参与抗逆的bHLH蛋白聚为一簇。荧光定量PCR分析表明,UV-B处理苦荞后,胚轴中FtbHLH3相对表达量在6 h内缓慢增加至1.08,12 h后显著上升至48 h的2.96;而子叶中FtbHLH3相对表达量在3 h后就显著上升,至24 h达到最大值6.64后趋于稳定。4℃冷处理苦荞后,胚轴和子叶中FtbHLH3相对表达量均随时间持续上升,并在48 h后达到最大值,分别为3.22和10.27。可见,本研究克隆的Ftb HLH3基因可能参与了苦荞对UV-B和寒冷等非生物胁迫的应答反应。
【作者单位】: 四川农业大学生命科学学院;西昌学院;
【关键词】: 苦荞 bHLH转录因子 基因克隆 非生物胁迫
【基金】:四川省国际合作项目(2015HH0047)基金资助
【分类号】:S517
【正文快照】: 苦荞(Fagopyrum tatarium)也称鞑靼荞麦,属蓼科植物,原产于我国及印度等地。由于抗逆性强,其主要分布在四川、云南、贵州和西藏等西部省区的一些干旱高寒山区、少数民族地区和边远山区。随着对苦荞营养价值和保健功能的深入研究,对苦荞的利用和开发也越来越受到重视(Kim et al
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