亚洲棉和雷蒙德氏棉MATE基因家族生物信息学及其同源基因在陆地棉中的表达分析

发布时间：2017-06-19 00:10

  本文关键词：亚洲棉和雷蒙德氏棉MATE基因家族生物信息学及其同源基因在陆地棉中的表达分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：多药和有毒化合物排出(MATE)蛋白家族是1个次级转运蛋白家族。为了更好地了解亚洲棉和雷蒙德氏棉中MATE蛋白的种类和数量,利用2种二倍体棉花基因组的氨基酸和c DNA数据库对MATE基因家族进行筛选,并分析亚洲棉和雷蒙德氏棉全基因组中MATE基因的种类和进化关系。结果显示,在亚洲棉基因组中初步鉴定了34个MATE基因,而在雷蒙德氏棉中筛选出42个MATE基因。基因结构和系统进化的比较分析表明,进化关系近的MATE基因在结构上基本是一致的。同时对陆地棉中克隆的Gh TT12及与其同一族的部分MATE基因进行荧光定量分析,推测其所在同一族的MATE基因功能可能与转运原花青素有关。这些结果为进一步深入分析棉花MATE基因的功能以及在原花青素转运中的作用提供了理论基础。
【作者单位】： 安徽农业大学生命科学学院;
【关键词】： 亚洲棉 雷蒙德氏棉 陆地棉 MATE基因家族 基因结构 系统进化分析 荧光定量PCR
【基金】：安徽省“115”产业创新团队(皖人才办[2011]2号) 安徽省生物学重点学科(2014SWQJ009)
【分类号】：S562
【正文快照】： 彩色棉是1种棉纤维具有天然色彩的棉花。目前应用的彩色棉主要包括棕色棉和绿色棉2大类,其中棕色棉色泽较稳定、产量较高,是彩色棉的主要栽培品种[1]。但是,与白色棉相比,彩色棉纤维颜色类型单调,色彩的自然稳定性差、色泽变化较大,且产量低、纤维品质较差[2],所以改善彩色棉

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 胡绍安,朱凤绥;亚洲棉染色体的观察方法[J];中国棉花;1983年06期

2 汪若海;亚洲棉在生产上重新露头[J];中国棉花;1988年04期

3 本刊编辑部;中国亚洲棉性状研究及其利用[J];中国棉花;1989年01期

4 周忠丽;吴仕勇;孙君灵;贾银华;潘兆娥;何守朴;杜雄明;;我国现存亚洲棉的表型多样性分析[J];植物遗传资源学报;2011年06期

5 彭仁海;刘玉玲;刘方;王春英;黎绍惠;张香娣;王玉红;王坤波;;亚洲棉7号染色体分离及文库构建[J];棉花学报;2012年05期

6 项显林;中国亚洲棉性状研究及其利用[J];中国农业科学;1988年04期

7 项显林,傅怀勤,刘国强,张祖杰,张秀芳,鲁黎明;中国亚洲棉的种植与利用[J];中国棉花;1989年01期

8 张柱汉;江苏省亚洲棉品种的演变与展望[J];江苏农业学报;1991年S1期

9 沈端庄;亚洲棉的几个典型种[J];作物品种资源;1992年04期

10 沈端庄,王庆华,刘东卫;亚洲棉地理族系类型及其亲缘关系[J];作物学报;1993年03期

中国重要会议论文全文数据库 前7条

1 李钦;肖光辉;朱玉贤;;棉花A、D亚基因组数据分析与演化及功能关系分析[A];2013全国植物生物学大会论文集[C];2013年

2 周忠丽;孙君灵;贾银华;潘兆娥;何守朴;庞保印;杜雄明;;基于SSR标记的亚洲棉遗传多样性分析[A];中国棉花学会2011年年会论文汇编[C];2011年

3 张雪妍;李付广;;亚洲棉耐旱相关基因GaP5CS的克隆及序列分析[A];中国棉花学会2007年年会论文汇编[C];2007年

4 王清连;董娜;刘阳阳;李成奇;;亚洲棉MicroRNA的鉴定及特性研究[A];中国棉花学会2012年年会暨第八次代表大会论文汇编[C];2012年

5 曹秋玲;;关于我国古代棉与木棉名实问题的探讨[A];2006年上海市科学技术史学术年会论文集[C];2006年

6 沈德珍;谢志坚;洪继仁;;棉花蜜腺电镜观察研究[A];第四次全国电子显微学会议论文摘要集[C];1986年

7 付小琼;杨付新;刘逢举;王秀玲;;杂交棉品种的SSR标记纯度现状透析[A];中国棉花学会2013年年会论文集[C];2013年

中国重要报纸全文数据库 前3条

1 本报记者 马爱平;我棉花生物学研究进入快速发展阶段[N];科技日报;2014年

2 齐俊生 李怀方;生物制种攻克棉花“癌症”[N];农资导报;2007年

3 记者　 范建 人民日报记者 蒋建科;我国首获转基因抗黄萎病棉花新株系[N];科技日报;2006年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 周忠丽;我国保存亚洲棉的遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2011年

2 张雪妍;亚洲棉（Gossypium arboreum L.）石系亚1号耐旱相关基因的克隆[D];中国农业科学院;2007年

3 杨娜;亚洲棉同源四倍体的诱导及鉴定[D];山西农业大学;2014年

4 余道乾;亚洲棉种皮特异性启动子的克隆及表达载体构建[D];中国农业科学院;2013年

5 张忠鑫;亚洲棉及雷蒙德氏棉端粒DNA序列的发掘与分析[D];南京农业大学;2013年

6 陶涛;澳洲棉与亚洲棉种子萌发期转录组测序及其差异表达分析[D];南京农业大学;2013年

7 刘玉玲;亚洲棉7号染色体文库构建及RGA克隆[D];中国农业科学院;2010年

8 赖童飞;亚洲棉短纤维发育突变体蛋白质差异分析[D];中国农业科学院;2007年

9 张玲;亚洲棉石系亚1号耐旱相关基因cDNA文库的构建与分析[D];中国农业科学院;2008年

10 陈银华;亚洲棉全生育期cDNA文库测序分析及耐旱相关基因克隆[D];华中农业大学;2011年

  本文关键词：亚洲棉和雷蒙德氏棉MATE基因家族生物信息学及其同源基因在陆地棉中的表达分析，，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：461149