PRLR、GDF9和BMPR-IB基因多态性与宗地花猪繁殖性状的关联性分析
发布时间:2017-06-22 03:11
本文关键词:PRLR、GDF9和BMPR-IB基因多态性与宗地花猪繁殖性状的关联性分析,,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:本研究以贵州宗地花猪经产母猪为实验素材,利用DNA池和DNA直接测序方法检测PRLR、GDF9和BMPR-IB基因的多态性,对各突变位点不同基因型个体与总产仔数、产活仔数、仔猪平均初生重和母猪泌乳力性状进行关联性分析,从而为提高宗地花猪繁殖性能提供有价值的分子辅助标记,推进选育进程。主要研究结果如下:1.在PRLR基因第10外显子上发现6个SNPs位点,其中C1115G、A1528T、G1600A、C1620T和A1789T均为错义突变,引起编码氨基酸改变。C1115G位点导致编码的脯氨酸(Pro)变为精氨酸(Arg),该位点多态性对宗地花猪的总产仔数、产活仔数和母猪泌乳力均有极显著影响(P0.01);A1528T位点导致编码的精氨酸(Arg)变为色氨酸(Trp),多态性对宗地花猪的总产仔数有极显著影响(P0.01),对产活仔数有显著影响(P0.05);G1600A位点导致编码的甘氨酸(Gly)变为半胱氨酸(Cys);其多态性对宗地花猪以上繁殖性状无显著影响(P0.05);C1620T位点导致编码的丙氨酸(Ala)突变为丝氨酸(Ser),多态性宗地花猪的总产仔数、产活仔数和泌乳力均有显著影响(P0.05),对仔猪平均初生重无显著影响(P0.05);A1789T位点导致编码的丝氨酸(Ser)突变为半胱氨酸(Cys),其多态性对宗地花猪的总产仔数、产活仔数和仔猪平均初生重均有显著影响(P0.05)。A1283C位点为同义突变,该位点多态性对宗地花猪的总产仔数、产活仔数和仔猪平均初生重有显著影响(P0.05),对母猪泌乳力均有极显著影响(P0.01)。2.在GDF9基因第2外显子上发现2个SNPs位点,其中C1009T位点为错义突变,导致编码的亮氨酸(Leu)变为苯丙氨酸(Phe),其多态性对宗地花猪的总产仔数有极显著影响(P0.01),对产活仔数和仔猪平均初生重均有显著影响(P0.05);T1014C位点为同义突变,其多态性对宗地花猪的总产仔数、产活仔数和仔猪平均初生重均有显著影响(P0.05)。3.在BMPR-IB基因第8外显子上发现2个SNPs位点,分别是G595C和C643T,两个位点均为错义突变,G595C导致编码的天冬氨酸(Asp)变为组氨酸(His),其多态性对宗地花猪的总产仔数和产活仔数均有显著影响(P0.05),对母猪泌乳力有极显著影响(P0.01);C643T位点导致编码的精氨酸(Arg)变为色氨酸(Trp),其多态性对宗地花猪的总产仔数和产活仔数均有显著影响(P0.05)。
【关键词】:宗地花猪 繁殖性状 PRLR基因 GDF9基因 BMPR-IB基因 多态性
【学位授予单位】:贵州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S828
【目录】:
- 摘要7-9
- Abstract9-11
- 前言11-12
- 第一章 文献综述12-25
- 1 中国地方猪种遗传资源概述12-13
- 2 贵州地方猪种遗传资源概述13
- 3 宗地花猪概述13-16
- 3.1 产区自然生态条件13-14
- 3.2 品种形成及数量14-15
- 3.3 体型外貌15
- 3.4 胴体及肉质性状15
- 3.5 繁殖性能15
- 3.6 品种保护和研究利用15-16
- 4 本研究涉及的功能基因16-23
- 4.1 PRLR基因16-19
- 4.2 GDF9基因19-21
- 4.3 BMPR-IB基因21-23
- 5 单核苷酸多态性检测方法——直接测序23
- 6 研究目的及意义23-25
- 第二章 PRLR、GDF9和BMPR-IB基因多性及其与猪繁殖形状的关联性分析25-72
- 1 试验材料25-28
- 1.1 试验动物样本25
- 1.2 主要试剂与溶液配制25-28
- 2 试验方法28-35
- 2.1 提取基因组DNA28
- 2.2 检测DNA浓度及纯度28-29
- 2.3 构建贵州宗地花猪品种DNA池29
- 2.4 宗地花猪繁殖性能测定29-30
- 2.5 宗地花PRLR、GDF9和BMPR-IB基因PCR扩增30-32
- 2.6 多态片段测序32
- 2.7 数据统计分析和相关软件32-35
- 3 结果与分析35-64
- 3.1 DNA提取结果35
- 3.2 PCR扩增结果35-37
- 3.3 PRLR、GDF9和BMPR-IB基因DNA池PCR测序结果37-38
- 3.4 宗地花猪个体PRLR基因测序结果分析38-53
- 3.5 宗地花猪个体GDF9基因测序结果分析53-58
- 3.6 宗地花猪个体BMPR-IB基因测序结果分析58-63
- 3.7 窝产活仔数与母猪泌乳量的关系63-64
- 4 讨论64-71
- 4.1 宗地花猪PRLR基因的群体遗传结构及其与繁殖性状的关联性分析64-67
- 4.2 宗地花猪GDF9基因的群体遗传结构及其与繁殖性状的关联性分析67-69
- 4.3 宗地花猪BMPR-IB基因的群体遗传结构及其与繁殖性状的关联性分析69-70
- 4.4 窝产仔数与母猪泌乳量70-71
- 4.5 对实践的指导意义71
- 5 结论71-72
- 参考文献72-80
- 致谢80-81
- 附录81-84
本文关键词:PRLR、GDF9和BMPR-IB基因多态性与宗地花猪繁殖性状的关联性分析,由笔耕文化传播整理发布。
本文编号:470590
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