对结肠癌中CD133相关基因及通路的生物信息学筛选

发布时间：2017-06-23 18:10

  本文关键词：对结肠癌中CD133相关基因及通路的生物信息学筛选，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:寻找与结肠癌干细胞表面标志物CD133表达密切相关的基因及其参与的生物过程。方法:通过生物信息学方法,利用GEO数据库中结肠癌基因芯片数据,结合R2平台,筛选出与CD133表达显著相关的基因,分析相关基因在不同性别、肿瘤原发部位及分期中的表达差异。同时,利用GO及KEGG工具对与CD133表达显著相关基因进行基因本体和KEGG通路分析。结果:130例结肠癌标本中126例检测出CD133表达,与CD133表达显著相关基因共598个(正相关504个,负相关94个),且正负相关性前7位基因的表达与患者性别、肿瘤原发部位及分期无明显关系(P0.05)。对基因本体及KEGG通路分析后发现,598个相关基因参与O聚糖合成、鞘糖脂合成等多个肿瘤相关生物过程。结论:CD133在结肠癌中普遍表达,CD133表达相关的基因参与了多个肿瘤生物过程,为深入研究结肠癌干细胞分子标志物相关基因及其参与的生物过程提供了一定参考。
【作者单位】： 武汉大学中南医院消化内科;湖北省肠病医学临床研究中心&肠病湖北省重点实验室;武汉大学中南医院肿瘤科;青海省第五人民医院肿瘤科;
【关键词】： CD 结肠癌干细胞 生物信息学 基因芯片
【基金】：国家自然科学基金青年基金资助项目(编号:210700130)
【分类号】：R735.35
【正文快照】： 结肠癌是全球高发的恶性肿瘤之一。近年来,国内其发病率也呈现逐年上升趋势。O’Brien等研究发现CD133+的人结肠癌干细胞具有自我更新和分化、重建成结肠癌细胞群体的能力,极少量这种细胞就能分化成新的肿瘤细胞进而增殖形成肿瘤[1],提示CD133可能是结肠癌肿瘤干细胞的表面标

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