大口黑鲈PACAP基因SNPs的筛选及其与生长性状的关联分析

发布时间：2017-06-27 18:19

  本文关键词：大口黑鲈PACAP基因SNPs的筛选及其与生长性状的关联分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：垂体腺苷酸环化激酶多肽(pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide,PACAP)是一种能够促进生长激素、促性腺激素和催乳素分泌的多效激素,属于胰高血糖素/分泌肽家族的成员。为探索PACAP基因多态性对大口黑鲈(Micropterus salmoides)生长性状的影响,本研究采用直接测序的方法在PACAP基因上检测到一个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点:A-2282C,基因型检测共发现3种基因型:AA、AC和CC,其基因型频率分别为0.034、0.645和0.321,A等位基因频率为0.356 3,C等位基因频率为0.643 7。随机选取同批繁殖、同塘养殖的327尾大口黑鲈用Snapshot方法进行SNPs位点检测和分型,构建最小二乘分析模型,分析基因型与生长性状的相关性。χ2检测结果显示,哈温-平衡常数为0.061 5,即该位点在所检测大口黑鲈群体中基本处于Hardy-Weinberg平衡状态,有效等位基因数(Ne)为1.846 5,期望杂合度(Ho)和观测杂合度(He)分别为0.540 9和0.644 2。方差分析结果显示,AC基因型群体的平均体质量、体高和全长相对于AA基因型群体分别增长了30.6%、10.7%和8.3%,相对于CC基因型群体分别增长了10.5%、4.7%和2.7%;且AC基因型群体在体质量、体高和全长上显著高于AA和CC基因型群体(P0.05)。另外,虽然AA基因型群体的平均体质量、体高和全长相对于CC基因型群体分别增长了18.1%、5.8%和5.4%,但AA型群体和CC群体在各生长性状上没有显著差异(P0.05)。该位点可能是影响大口黑鲈生长性状的的主效数量性状核苷酸(quantitative trait nucleotides,QTN)或与之紧密连锁,可作为大口黑鲈选育的候选分子标记。
【作者单位】： 中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;
【关键词】： 大口黑鲈 垂体腺苷酸环化激酶多肽(PACAP) SNP 生长
【基金】：国家科技支撑计划(No.2012BAD26B03) 国家自然科学基金(No.31201985) 农业部引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目(No.2011-G12)
【分类号】：S917.4
【正文快照】： 垂体腺苷酸环化激酶多肽(pituitary adenylatecyclase-activating polypeptide,PACAP)是鱼类的一种多效激素,不仅具有刺激和提高生长激素、促性腺激素、催乳激素和生长乳素分泌的生物学功能(Montero et al.,1998;Matsuda et al.,2008),还参与动物采食量(Nakata et al.,2004)和

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7 丁建华;，

本文编号：490799