基于转录组测序技术的重症手足口病相关基因研究

发布时间：2017-07-02 03:09

  本文关键词：基于转录组测序技术的重症手足口病相关基因研究，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的应用转录组测序技术(RNA-seq)分析重症手足口病(SHFMD)患者外周血单个核细胞(PBMC)转录组情况,筛选SHFMD相关基因,探讨其发生的可能免疫机制。方法收集2014年5月至8月深圳市第三人民医院收治的重症和轻症手足口病(MHFMD)患儿各5例,以及5例健康体检儿童的外周血,均分离PBMC,采用转录组测序技术筛选显著的差异表达基因(DEGs),并通过实时荧光定量PCR对DEGs进行验证。结果 SHFMD组相对健康对照组共117个DEGs,其中108个基因上调,9个基因下调;SHFMD组相对MHFMD组共26个DEGs,其中14个基因上调,12个基因下调;两组DEGs中共有8个相同基因,其中TNFRSF13C、IL-7R、THBS1和VEGFA下调,S100A8、S100A12、IL-8和IL-1β上调(P均0.05)。结论 S100A8、S100A12、IL-8、IL-1β、TNFRSF13C、IL-7R、THBS1和VEGFA是SHFMD相关的差异表达基因,可能在SHFMD的发生中起重要作用,有望成为手足口病重症化的预测基因。
【作者单位】： 南华大学附属第一医院感染科;南华大学附属深圳市第三人民医院感染科;
【关键词】： 转录组测序 重症手足口病 预测基因
【基金】：深圳市新发传染病重点专科基金(N o.201161) 深圳市科技创新委项目(N o.JCYJ20150402111430623)
【分类号】：R725.1
【正文快照】： 手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)主要是由肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)和柯萨奇A组16型(Coxsackievirus A 16,Cox A16)引起的急性小儿传染病,主要表现为手、足、口腔等部位的疱疹、斑丘疹。少数患者病情进展迅速,在发病1~5 d出现脑炎、脑膜脑炎、神经源性肺

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本文编号：508350