金钱鱼MHC Ⅱ β基因结构、多态性与组织表达分析

发布时间：2017-07-03 09:03

  本文关键词：金钱鱼MHC Ⅱ β基因结构、多态性与组织表达分析

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【摘要】：为探究金钱鱼(Scatophagus argus)MHC Ⅱβ基因的结构和特性,采用同源克隆和RACE等技术,在获得cDNA全序列的基础上,分析其内含子序列、基因多态性和组织表达情况。结果表明,金钱鱼MHC IⅡβ基因cDNA序列全长1172 bp,其中5′UTR长34 bp,3′UTR长388 bp,开放阅读框(ORF)长750 bp,编码249个氨基酸,包含信号肽、β1结构域、β2结构域、连接肽(CP)、跨膜区(TM)和胞质区(CYT);MHC Ⅱβ基因由6个外显子和5个内含子组成,其中内含子3将β2结构域分开。从43尾金钱鱼的209个有效克隆中,获得209条不同的核苷酸序列,可归为48个等位基因主型,分别命名为Scar-DXB*0101~Scar-DXB*4801,揭示金钱鱼MHC Ⅱβ基因的多态性很丰富。RT-PCR检测发现,金钱鱼MHC Ⅱβ基因在所检测的11种组织中均有表达,其中在脾、鳃、肠和皮肤中表达量较高,在肾、胃、心脏表达量中等,而在眼、脑、肝、肌肉中表达量较低。对健康金钱鱼人工感染嗜水气单胞菌后,发现其MHC Ⅱβ基因在肝、脾、鳃、肾等组织中的表达量均发生了不同程度的变化,证明该基因在金钱鱼免疫反应中有重要作用。在NJ法构建的系统树中,金钱鱼与舌齿鲈、大西洋鲑等硬骨鱼类的亲缘关系相对较近,而与铰口鲨、原鸡、小鼠、人等的亲缘关系则依次渐远。
【作者单位】： 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室;
【关键词】： 金钱鱼 MHC Ⅱ β基因 基因结构 多态性 组织表达
【基金】：国家自然科学基金项目(41176109)
【分类号】：S917.4
【正文快照】： 主要组织相容性复合体(majorhistocompatibility complex,MHC)由紧密连锁的高度多态基因位点组成,存在于多数脊椎动物体内,且在机体的适应性免疫中发挥非常重要的作用,因此一直受到国内外研究者的关注。自Hashimoto等[1]于1990年首次报道了鲤(Cyprinuscarpio)的部分MHC基因序

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本文编号：513015