兰州鲇MyoD基因的克隆与生物信息学分析

发布时间：2017-07-04 10:09

  本文关键词：兰州鲇MyoD基因的克隆与生物信息学分析

  更多相关文章： 兰州鲇(Silurus lanzhouensis) MyoD 基因克隆 生物信息学

【摘要】：为研究兰州鲇(Silurus lanzhouensis)生长性状相关基因,运用RT-PCR、TA克隆和核酸测序等技术对兰州鲇MyoD基因的CDS区及全基因进行克隆和生物信息学分析。获得兰州鲇MyoD基因的完整CDS区序列810 bp(Gen Bank登录号:KT277551)及MyoD基因全序列1 210 bp(Gen Bank登录号:KT339175),包括部分5'端63 bp和3'端58 bp;ORF区含有3个外显子和2个内含子,外显子长度分别为510 bp、80 bp和220 bp,内含子长度分别为156 bp和123 bp,编码269个氨基酸残基组成的可溶酸性蛋白质;预测亚细胞定位MyoD主要分布于细胞核(56.5%),MyoD二聚体结构是一个螺旋-环-螺旋(b HLH)。基于12种鱼类MyoD基因CDS序列构建系统发育树及编码区同源性比较,分析结果表明,MyoD基因编码区在进化过程中比较保守,且兰州鲇MyoD与斑点叉尾、白鲶鱼、蓝鲶鱼之间存在较高的同源性。
【作者单位】： 甘肃农业大学动物科学技术学院;宁夏回族自治区水产研究所;宁夏渔业工程技术研究中心;
【关键词】： 兰州鲇(Silurus lanzhouensis) MyoD 基因克隆 生物信息学
【基金】：国家自然科学基金项目(31360633) 宁夏对外科技合作项目 宁夏自然科学基金(NZ14212) 国家科技支撑计划项目(2012BAD25B09)
【分类号】：S917.4
【正文快照】： 提高鱼类生长速度和抗性成为目前鱼类育种研究领域的热点。已有研究表明,鱼类肌肉生长主要受生肌调节因子MRFs家族(Myogenic regulatoryfactors)调控[1],该家族包括Myo D、Myo G、Myf5和MRF4转录调节因子,其中Myo D基因的全称是成肌分化抗原(Myogenic differentiation antigen

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本文编号：517341