辣椒杂交种与亲本苗期叶片基因差异表达分析

发布时间：2017-07-14 17:17

  本文关键词：辣椒杂交种与亲本苗期叶片基因差异表达分析

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【摘要】：目前辣椒杂种优势的利用已取得很大成效,但是辣椒杂种优势的分子机理仍然不明。辣椒杂种优势的分子机理是一个重要的生物学和农学课题。为比较分析苗期辣椒杂交种(D6×D7,D7×D6)及其亲本(D6、D7)的成熟功能叶转录谱,把4个功能叶c DNA文库在Illumina Hi Seq 2000平台进行RNASeq分析。通过转录组测序,共得到0.6亿条原始的reads,经过筛选获得0.44亿条高质量reads(100 bp)。基因存在与缺失变异统计结果表明,单亲表达一致型有1068个(6.20%)和780个(4.56%)基因分别在正交(D6×D7)和反交(D7×D6)中被检测到,在4种基因存在与缺失变异类型中所占比例比较高。对双亲表达量不同的基因作进一步表达模式分析,结果表明,杂种(正、反交)与双亲相比,大部分基因呈均非加性表达,加性表达基因比例不足8%,在非加性表达基因中,超显性表达的基因占大多数,正、反交分别为66.08%和62.96%,这与偏单亲的显性模型分析结论相一致。
【作者单位】： 广东省农科院蔬菜研究所;福建农林大学作物科学学院;
【关键词】： 辣椒 杂种优势 转录组 RNA-seq
【基金】：国家自然科学基金(31301776) 广东省科技计划项目(2015B0202009,2016B070701010) 广州市科技计划项目(201510010119)
【分类号】：S641.3
【正文快照】： 杂种优势是指遗传结构不同的两个群体(或个体)杂交所产生的F1代在生产、生活、繁殖和适应性等方面优于双亲均值或超过两个亲本的现象[1]。杂交育种是根据品种的选育目标选配亲本,通过杂种优势群的划分、自交系的培育、对自交系一般配合力和特殊配合力的检测等手段,获得新品种

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4 王sコ，

本文编号：541962