青皮苦瓜鲨烯合酶基因ORF序列的克隆和正选择分析

发布时间：2017-07-15 07:09

  本文关键词：青皮苦瓜鲨烯合酶基因ORF序列的克隆和正选择分析

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【摘要】：为研究葫芦科植物中三萜皂苷生物合成通路中的关键酶鲨烯合酶的分子进化,克隆青皮苦瓜鲨烯合酶基因的c DNA序列,并进行正选择分析。根据葫芦科植物之间的同源性设计青皮苦瓜鲨烯合酶引物。采用3'RACE和5'RACE快速扩增技术分两步进行巢式PCR扩增鲨烯合酶ORF序列。根据克隆出来的青皮苦瓜编码框序列以及在Gen Bank数据库中完整的陆生植物鲨烯合酶编码框序列信息,用贝叶斯方法和PAML4软件进行鲨烯合酶的正选择分析。青皮苦瓜鲨烯合酶基因c DNA的克隆,命名为Mc SS,其c DNA序列全长为1 548 bp,ORF 1 251 bp,编码417个氨基酸残基。通过正选择运算,检测到33个正选择位点,其正选择位点主要集中在第二跨膜区及其两侧。本研究成功克隆得到青皮苦瓜鲨烯合酶基因全长c DNA序列并对其正选择分析,在三萜合成通路上为鲨烯合酶的定点突变提供重要参考。
【作者单位】： 广西医科大学生物化学与分子生物学教研室;广西高校生物分子医学研究重点实验室;
【关键词】： 青皮苦瓜 基因克隆 鲨烯合酶 正选择
【基金】：国家自然科学基金(No.31260069)资助
【分类号】：S642.5;Q943.2
【正文快照】： Cloning and Positive Selection Analysis of Squalene Synthase Gene ORF inGreen Momordica charantiaQian Jieying1Ma Chengtong1Chao Naixia1,2Chen Qicong1Lan Xiuwan1,2Sun Jian1,2Wu Yaosheng1,2*1 Department of Biochemistry and Molecular Biology,Guangxi Medical

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本文编号：542848