谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析

发布时间：2017-07-16 08:10

  本文关键词：谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析

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【摘要】：生长素应答因子(ARF,auxin response factors)是一类可以结合在生长素应答基因启动子部位的转录因子,在植物的生长发育中起至关重要的作用。本研究以谷子为材料,共鉴定出24个ARF基因,命名为Si ARFs。利用生物信息学对谷子Si ARFs基因的结构、染色体分布、基因倍增模式、系统进化以及基因的表达模式进行分析。结果表明,Si ARF基因家族在染色体上呈不均匀分布,除2号染色体外,其他染色体上都有该家族基因,基因的扩增模式为分散复制与片段复制。Si ARFs基因家族具有相对保守的结构,即包含1个保守的B3 DNA结构域、ARF结构域和Aux/IAA结构域,ARF蛋白的3D结构含有3个α螺旋和7个β折叠结构。进化树分析表明谷子ARF蛋白和物种相近的高粱、玉米聚在一起。大多数ARF基因在谷子根、茎、叶和穗中都有表达,且不同基因表达量有较大差异。
【作者单位】： 河北北方学院;河北省农林科学院谷子研究所;
【关键词】： 谷子 ARF 生物信息学分析 蛋白结构
【基金】：国家科技重大专项(2014ZX0800909B) 河北省高等学科拔尖人才选拔与培养计划(BRZ-234) 河北北方学院重大项目(ZD201305);河北北方学院作物学重点实验室
【分类号】：S515
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160406.1117.012.html第一作者研究方向为药物化学。E-mail:929353642@qq.com生长素(auxin)是发现最早、研究最多、在植物体内普遍存在的植物激素。生长素在植物的顶端优势、微管的分化、胚胎的分化、根和茎的形态建成等植物

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 司马晓娇;郑炳松;;植物生长素原初响应基因Aux/IAA研究进展[J];浙江农林大学学报;2015年02期

2 李晓燕;陈雪梅;盖颖;;杨树不同组织中ARF表达与生长素相关性研究[J];广东农业科学;2013年06期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 赵艳;瓮巧云;马海莲;宋晋辉;袁进成;王凌云;董志平;刘颖慧;;谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析[J];植物遗传资源学报;2016年03期

2 李爱;于雪;冯涛;李慧;于玮玮;彭立新;;落叶松生长素受体基因LkTIR1的克隆及功能分析[J];植物生理学报;2016年01期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前5条

1 何勇清;方佳;余敏芬;方仲相;江波;潘寅辉;郑炳松;;植物质膜内在水通道蛋白PIPs的分子生物学研究进展[J];浙江农林大学学报;2012年03期

2 张俊红;孟成生;张彩英;史峥;王笑颖;李爱丽;马峙英;;小麦和水稻auxin基因家族的生物信息学比较分析[J];华北农学报;2009年06期

3 郑炳松;陈苗;褚怀亮;艾雪;黄有军;李雪芹;黄坚钦;;用cDNA-AFLP技术分析山核桃嫁接过程中的CcARF基因表达[J];浙江林学院学报;2009年04期

4 王正加;黄有军;夏国华;郑炳松;金松恒;黄坚钦;;山核桃APETALA1同源基因的克隆与序列分析[J];浙江林学院学报;2008年04期

5 董秀春;樊金会;于学宁;束怀瑞;;一个属于Aux/IAA基因家族的毛白杨PtIAA1的克隆和序列分析(英文)[J];分子植物育种;2007年04期

【相似文献】

中国硕士学位论文全文数据库 前1条

1 刘艳;玉米全基因组ARF基因的分析及进化研究[D];安徽农业大学;2011年

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本文编号：547730