Fst统计法评估KIF1B基因rs17401966多态性与肝细胞癌风险Meta分析的异质性来源
本文关键词:Fst统计法评估KIF1B基因rs17401966多态性与肝细胞癌风险Meta分析的异质性来源
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【摘要】:目的采用Fst统计法评估二分类变量Meta分析的异质性来源。方法检索Google Scholar、EMBASE、PubMed、ISI Web of Knowledge和CNKI数据库,搜集有关KIF1B基因rs17401966多态性与肝细胞癌风险关系的病例-对照研究。应用Stata 12.0软件进行Meta分析,使用Arlequin 3.5软件分析研究人群间的遗传分化程度。结果最终纳入5个病例-对照研究,合计12个研究人群。对12个人群的Meta分析结果显示KIF1B基因rs17401966G等位基因与HCC风险负相关(OR=0.77,95%CI:0.65~0.93;P=0.005),然而合并结果存在很强的异质性。通过对12个纳入人群进行遗传分化检验,发现Zhang等的5个研究人群与其他研究人群存在不同程度的遗传分化,进而根据Fst值进行适当的亚组分析,把组8和组9异质性检验的I2值降到了25%以下,然而组8和组9的Meta分析结果却不一致。结论研究显示在对KIF1B基因rs17401966多态性与肝细胞癌风险进行Meta分析时,通过对纳入人群的遗传分化检验,可以发现Meta分析的异质性来源。
【作者单位】: 福建医科大学附属闽东医院检验科;
【关键词】: 异质性 多态性 Meta分析 遗传分化 肝细胞癌
【基金】:福建省自然科学基金项目(2016J01596) 福建省宁德市科技计划项目(20150013)
【分类号】:R735.7
【正文快照】: 2010年,Zhang等[1]开展的中国人群乙型肝炎病毒(HBV)感染相关肝细胞癌(HCC)的全基因关联分析(GWAS),发现1p36.22区域的KIF1B基因单核苷酸多态性rs17401966与HCC风险显著相关,其5个研究人群的联合P值达3.4×10-19。然而,其他学者后继重复研究并没有取得相一致结果,可能由于遗传
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,本文编号:552115
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