梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析

发布时间：2017-07-17 08:35

  本文关键词：梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析

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【摘要】：以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为Df UGP(Genebank:KJ525752)。测序结果显示该序列全长1561 bp,包含一个完整的ORF框,长度为1422 bp,编码473个氨基酸。梁山慈竹UGP基因与巨龙竹、绿竹、水稻、大麦、玉米、甘蔗的具有高度的同源相似性,编码的蛋白结构较为相似,均含有N端区域、中心区域和C端区域,且蛋白三级结构中都具有NBloop环和l-loop环。Df UGP具有N端的UDPGP功能域,其位于第90~379氨基酸,证明Df UGP属于尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因家族。
【作者单位】： 西南科技大学植物细胞工程实验室;四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心;
【关键词】： 梁山慈竹 UGP 克隆 生物信息学
【基金】：国家自然科学基金青年基金项目(31400257;31400333) 四川省“十二五”重点公关资助项目(2011YZGG-10) 四川省应用基础研究基金资助项目(2013JY0182) 四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心基金资助(12zxsk07;13zxsk01)
【分类号】：S795.5
【正文快照】： 梁山慈竹纤维质量好、含量丰富,在四川已经形成了以其为龙头的竹浆造纸工业产业链[1],然而在造纸过程中原料中纤维素和木质素的含量将直接影响制浆率和纸的质量[2]。以往研究发现,纤维素的生物合成需要多种酶协同参与[3],而UGPase可能起着重要作用。UGPase又称尿苷二磷酸葡萄

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本文编号：552781