利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征

发布时间：2017-07-18 23:22

  本文关键词：利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征

  更多相关文章： 空肠弯曲菌 基因芯片 遗传变异

【摘要】：目的为分析我国弯曲菌遗传特征,本研究根据已发表多株弯曲菌的全基因组测序特征及比对结果自行设计基因芯片,利用芯片对我国不同宿主来源菌株进行遗传特异性分析。方法根据前期基因组水平比对分析的结果,利用Combimatrix tiling Custom ArrayTM90K芯片,设计DNA芯片。芯片包含已测序菌株ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384个CDS的探针序列,以及空肠弯曲菌耐药及致病性相关2个质粒共80个CDS的探针序列,与脂寡糖的合成相关基因簇16种共219个CDS的探针序列、荚膜多糖合成相关基因簇7种共160个CDS的所有序列。对我国不同宿主来源27株分离菌株提取DNA,利用芯片进行杂交,获得杂交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚类特点。结果中国菌株的主要变异区域主要存在于与脂寡糖、荚膜多糖合成相关的基因簇、鞭毛修饰相关的基因簇、DNA限制/修饰相关的基因簇以及空肠弯曲菌Mu样噬菌体基因簇。基因组水平不同来源菌株CDS分布的聚类结果没有发现显著的宿主归因特点,但GBS相关菌株脂寡糖合成相关基因组成具有共性特征。结论通过验证以及与过去研究的比较,本次研究中的基因芯片技术结果准确可信,本研究所用基因芯片在分析空肠弯曲菌基因多态性方面具有很好的优势,可用于弯曲菌遗传特征和重要毒力因子的分析和检测。
【作者单位】： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室;
【关键词】： 空肠弯曲菌 基因芯片 遗传变异
【基金】：国家自然科学基金(No.81271789) 国家重点基础研究发展计划(973计划)(No.2013CB127204)~~
【分类号】：R378
【正文快照】： 梁昊,刘红莹,尤元海,顾一心,张艾煜,王敏,何利华,孟凡亮,张建中,张茂俊自2000年2月第一株空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)NCTC11168的全基因组序列完成图发布以来,陆续有多株空肠弯曲菌完成了全基因组测序。对不同菌株的序列比较分析显示空肠弯曲菌遗传变异度较大[1-8]。这

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 张建中;;空肠弯曲菌病[J];传染病信息;2005年02期

2 高正琴;张强;邢进;王春玲;贺争鸣;邢瑞昌;;空肠弯曲菌套式PCR快速检测方法的建立与初步应用[J];中国比较医学杂志;2006年12期

3 袁宝君;吴高林;乔昕;戴建华;;多重PCR与传统方法检测空肠弯曲菌的比较研究[J];卫生研究;2007年01期

4 栾军;祝长青;蒋原;金伟青;;空肠弯曲菌保存方法的比较[J];口岸卫生控制;2007年04期

5 张茂俊;张建中;;空肠弯曲菌耐药现状[J];疾病监测;2007年12期

6 拜世英;;浅述空肠弯曲菌诱发格林-巴利综合征的机制和防控[J];医学与哲学(临床决策论坛版);2010年03期

7 邢丛丛;李震中;白欣立;徐飞;付金生;马海阳;李文倩;卢小卫;;空肠弯曲菌Penner O:19 galE基因真核表达质粒的构建[J];脑与神经疾病杂志;2012年02期

8 陆磊;焦新安;黄金林;;空肠弯曲菌细胞致死性肿胀毒素研究进展[J];中国人兽共患病学报;2012年10期

9 邢丽萍;薛永春;杨月清;;空肠弯曲菌分型技术的研究进展[J];公共卫生与预防医学;2012年06期

10 刘孝波;蒋栋能;蒲晓允;;利用环介导恒温扩增法快速检测空肠弯曲菌[J];医学研究杂志;2013年08期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 张弓;黄金林;焦新安;;空肠弯曲菌“活的非可培养状态”研究进展[A];中国畜牧兽医学会2009学术年会论文集（下册）[C];2009年

2 韩茜倩;师以康;王凤山;;在空肠弯曲菌表达N型糖蛋白的研究进展[A];山东省药学会2010年生化与生物技术药物学术研讨会论文集[C];2010年

3 高正琴;张强;邢进;王春玲;贺争鸣;邢瑞昌;;空肠弯曲菌套式PCR快速检测方法的建立及初步应用[A];中国实验动物学会第七届学术年会论文集[C];2006年

4 刘光明;蔡慧农;曹敏杰;苏文金;;一种检测活的非可培养状态空肠弯曲菌的新型方法[A];提高全民科学素质、建设创新型国家——2006中国科协年会论文集[C];2006年

5 薛峰;徐飞;陈颖;李震中;张睿;张常印;蒋原;李怀林;陆承平;;2006-2008年华东地区空肠弯曲菌动物源分离株分子分型研究[A];动物检疫学分会2010年学术年会论文集[C];2010年

6 黄金林;许海燕;包广宇;张弓;刘佩红;姜峰;潘志明;刘秀梵;焦新安;;不同来源空肠弯曲菌分子流行病学分析[A];中国畜牧兽医学会2009学术年会论文集（上册）[C];2009年

7 刘光明;蔡慧农;曹敏杰;苏文金;;一种检测活的非可培养状态空肠弯曲菌的新方法[A];中国食品科学技术学会第五届年会暨第四届东西方食品业高层论坛论文摘要集[C];2007年

8 王君;刘秀梅;郭云昌;;鸡肉空肠弯曲菌标准制定过程中风险评估的应用[A];达能营养中心青年科学工作者论坛优秀论文集2010年第5期[C];2010年

9 祝令伟;郭学军;冯书章;;空肠弯曲菌蛋白质组学研究概述[A];中国畜牧兽医学会生物制品学分会中国微生物学会兽医微生物学专业委员会2010年学术年会（第三届中国兽药大会学术论坛）论文集[C];2010年

10 孙新婷;沈宝铨;侯凤琴;于岩岩;;北京地区空肠弯曲菌的临床分析[A];中华医学会全国第九次感染病学学术会议论文汇编[C];2006年

中国重要报纸全文数据库 前1条

1 曾繁玉;格林-巴利综合征分子研究有重大突破[N];中国医药报;2002年

中国博士学位论文全文数据库 前5条

1 张茂俊;格林—巴利综合征相关空肠弯曲菌遗传特征分析[D];中国疾病预防控制中心;2008年

2 田新英;吉兰-巴雷综合征相关空肠弯曲菌的蛋白质谱特征分析[D];河北医科大学;2004年

3 冯永嘉;空肠弯曲菌粘附蛋白基因工程疫苗的实验研究[D];重庆医科大学;2003年

4 黄金林;我国部分地区鸡源空肠弯曲菌流行病学及运送flaA基因的壳聚糖纳米DNA疫苗免疫生物学特性研究[D];扬州大学;2008年

5 束晓梅;空肠弯曲菌galE基因变异株的临床意义研究[D];重庆医科大学;2004年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 杨静;空肠弯曲菌致豚鼠不同时间段周围神经病理损伤的研究[D];河北医科大学;2015年

2 张华威;空肠弯曲菌膜融合蛋白CmeA、外膜蛋白CmeC的表达、纯化与结晶筛选[D];复旦大学;2012年

3 吴高林;空肠弯曲菌快速检测方法建立和应用的研究[D];南京医科大学;2007年

4 杨静;空肠弯曲菌体外非理想条件下性状变化评估[D];河北医科大学;2013年

5 尹衍新;基于CjaA蛋白检测鸡空肠弯曲菌抗体的间接ELISA方法建立及其单克隆抗体研制[D];扬州大学;2010年

6 高爱民;空肠弯曲菌铁相关受体基因序列的分析研究[D];河北医科大学;2011年

7 林世永;实时定量PCR检测人类腹泻粪便中空肠弯曲菌的研究与评价[D];南方医科大学;2008年

8 李文倩;C.jejuni在不同条件下的形态学变化及C.jejuni的分离[D];河北医科大学;2012年

9 郑扬云;食品中空肠弯曲菌的污染分布规律及遗传多样性研究[D];广东工业大学;2013年

10 朱利;空肠弯曲菌质粒研究初探[D];甘肃农业大学;2001年

，

本文编号：560292