microRNA对儿童哮喘靶基因调控的生物信息学分析

发布时间：2017-07-20 18:23

  本文关键词：microRNA对儿童哮喘靶基因调控的生物信息学分析

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【摘要】：目的应用生物信息学技术分析尘螨过敏哮喘儿童特异性microRNA(miRNA)及其靶基因筛选,探讨哮喘发病机制。方法采用病例对照研究,在62对尘螨过敏哮喘患儿及同龄正常无过敏儿童中,随机选取12例哮喘患儿及对照者进行microRNA芯片分析,比较两组中存在异常表达的miRNAs,并在其余病例中进行RT-qPCR验证和生物信息学分析。结果尘螨过敏哮喘儿童中有6个microRNA表达较对照组下调2倍以上,分别为miRNA-151a-5p、625-5p、126-3p、513a-5p、27b-3p、22-3p,差异均有统计学意义(P0.05)。进一步的生物信息学富集分析发现,这些microRNAs调控的PPARGC1B、CBL、ONECUT2、ESR1、EGFR、SYK、STAT1与炎症因子信号通路有着显著性关联(P0.05)。结论 miRNA-625-5p、513a-5p、27b-3p、22-3p可能通过共同调控相关靶基因,形成一个网络通路,参与尘螨诱发儿童哮喘的发生。
【作者单位】： 上海市儿童医院上海交通大学附属儿童医院呼吸科;上海医学遗传研究所;
【关键词】： microRNA 哮喘 生物信息学 信号通路 儿童
【基金】：上海市卫生和计划生育委员会资助项目(No.20124132)
【分类号】：R725.6
【正文快照】： micro RNA(mi RNA)是非蛋白质编码的小分子RNA,长度约21~25碱基。现在有越来越多证据显示,mi RNA参与了不同生物进程,包括细胞增殖、变异和凋亡。大多数人类疾病,如各种类型癌症、代谢、神经变性、感染、慢性炎症和自身免疫性疾病有mi RNA表达和功能异常[1]。这些功能的产生建

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本文编号：569415