2013～2014年中国大陆四株不同基因型麻疹病毒分离株血凝素基因特征分析

发布时间：2017-07-27 07:07

  本文关键词：2013～2014年中国大陆四株不同基因型麻疹病毒分离株血凝素基因特征分析

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【摘要】：研究2013~2014年中国大陆分离到4株不同基因型麻疹野毒株血凝素蛋白(HA)编码基因的基因和氨基酸特征及变异程度。选取2013~2014年我国优势基因型H1a1株,输入基因型B3、D8和D9各1株作为代表株,核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增H基因编码区全序列(1 854bp)并测序,使用sequencher5.0进行序列拼接,并与GenBank下载的H1基因型4株、B3基因型和D8基因型各8株、D9基因型2株及中国A基因型麻疹疫苗株沪191(S191)和长47(C47)H基因全序列进行比较分析,使用MEGA5.0比对并构建亲缘性关系树及分析其核苷酸和氨基酸差异。4株不同基因型野毒株与A基因型疫苗株H基因核苷酸和氨基酸同源性为94.2%~96.7%,95.4%~96.7%,氨基酸差异数为20~28,其中Beijing14-1(H1a)与A基因型疫苗株H基因同源性最低。H1a毒株与1993~1994年分离的毒株核苷酸同源性较高为97.7%~98.2%。Beijing14-1(H1a)和Shanghai14-1(B3)第240位点氨基酸位点由S→N,导致HA蛋白的1个N-糖基化位点丢失。4株野毒株与中国A基因型疫苗株H基因核苷酸和氨基酸同源性较高,且重要中和抗原位点未出现明显突变。从基因层面上分析A基因型疫苗株对我国流行的H1a亚型及B3、D8和D9输入性基因型野毒株感染仍具有较好的保护效果。
【作者单位】： 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;山东省疾病预防控制中心病毒病预防控制所;
【关键词】： 血凝素蛋白 麻疹病毒 基因特征 输入性
【基金】：国家自然科学基金课题(项目号:81371791) 国家科学技术重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治课题(编号:2012ZX10004215、2013ZX10004202、2012ZX10004401、2012ZX10004201-003) 世界卫生组织西太平洋区麻疹参比实验室的职能(WP CHN AAA 011XZ 08)
【分类号】：R373
【正文快照】： 麻疹是一种由麻疹病毒感染引起的急性发热出疹性呼吸道传染病。麻疹病毒是副粘病毒科麻疹病毒属[1],为单股负链RNA病毒,基因组含有6个开放阅读框架,分别编码6种蛋白,从5’到3’分别为依赖于RNA的RNA聚合酶,血凝素蛋白(HA),融合蛋白(F),膜蛋白(M),磷蛋白(P),和核蛋白(N),其中HA

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