人MTERF4基因启动子的生物信息学研究

发布时间：2017-07-31 17:00

  本文关键词：人MTERF4基因启动子的生物信息学研究

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【摘要】：人线粒体转录终止因子4(mitochondrial transcription termination factor 4,MTERF4)基因属于线粒体转录终止因子基因超家族,其编码的蛋白质是调控线粒体核糖体生物合成和线粒体蛋白质翻译的重要因子。目前,MTERF4基因自身的表达调控机制仍不清楚。为了探讨人MTERF4基因启动子区的序列特征和基因转录调控机制,采用进化足迹法,利用生物信息学在线软件对人MTERF4基因上游5'端的启动子分布、转录因子及其结合位点、CpG岛进行分析。结果表明,人MTERF4基因上游5'端3 000 bp的核苷酸序列至少存在3个启动子,其中1 799~2 368 bp之间可能包含核心启动子。启动子区序列中存在1个长为558 bp的CpG岛。人和小鼠MTERF4同源基因的启动子区有1个保守区域,存在18个共有的转录因子结合位点。通过生物信息学软件分析人MTERF4基因启动子,提高了针对该基因启动子的研究效率,为后续实验深入研究启动子的功能奠定了重要的理论基础。
【作者单位】： 大理大学基础医学院;云南省昆虫生物医药研发重点实验室;云南大学生命科学学院;
【关键词】： 线粒体转录终止因子基因(MTERF) 启动子 CpG岛 转录因子 生物信息学
【基金】：国家自然科学基金项目(81560458,31601155) 云南省教育厅科学研究基金重点项目(2014Z126) 大理大学博士科研启动基金项目(BSKY2012018);大理大学大学生创新创业计划项目(201402)
【分类号】：Q811.4
【正文快照】： 线粒体转录终止因子4(mitochondrial transcrip-tion termination factor 4,MTERF4)亦被命名为线粒体转录终止因子结构域2(mitochondrial transcrip-tion termination factor domain containing 2,MTER-FD2),该基因归属于线粒体转录终止因子基因超家族,是通过PSI-BLAST方法鉴

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本文编号：600155