葡萄miR164家族生物信息学分析及靶基因预测

发布时间：2017-08-16 17:24

  本文关键词：葡萄miR164家族生物信息学分析及靶基因预测

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【摘要】：MicroRNAs(miRNAs)对植物抗逆及生长发育过程起着重要的调控作用,而miR164是植物特有的miRNA,它对应的靶基因主要是NAC转录因子家族。采用生物信息学方法对葡萄以及其他几个物种的miR164家族成员前体进行进化分析、前体二级结构预测、成熟序列碱基保守性分析以及在葡萄NAC转录因子家族71个成员中进行靶基因预测分析。结果表明:葡萄miR164家族成员的前体序列与双子叶植物聚在一个分支,符合进化规律;葡萄miR164家族4个成员前体序列均可形成稳定的二级茎环结构,成熟序列的碱基保守性较高;葡萄miR164家族成员对应的NAC家族靶基因有2个(GSVIVT01007982001与GSVIVT01020478001),经在NCBI进行BLAST分析,发现均与植物的根发育相关。这暗示着葡萄miR164家族与其靶基因在植物的抗逆过程中发挥重要的调控作用。
【作者单位】： 连云港市农业科学院;
【关键词】： 葡萄 miR 靶基因 抗逆 生物信息学
【基金】：苏北科技发展计划项目(BN2014101)
【分类号】：S663.1
【正文快照】： 微小RNA(MicroRNAs)是一类非编码小分子RNA,在植物中主要通过介导靶基因降解对调控生长发育及抗逆过程发挥作用[1]。近年来的研究表明,miRNAs在植物响应逆境胁迫过程中起着重要的作用[2],如在毛竹(Phyllostachys edu-lis)中,miR397和miR1432的表达量均受不同胁迫条件的影响,如，

本文编号：684541