白洗猪PID1基因克隆及序列分析

发布时间：2017-08-22 07:28

  本文关键词：白洗猪PID1基因克隆及序列分析

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【摘要】：本研究旨在对白洗猪磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因进行克隆和生物信息学分析。采用Nest PCR及T克隆技术对白洗猪PID1基因进行克隆测序,运用生物学分析软件分析其结构功能及其在种内及种间的遗传进化关系。结果表明,白洗猪PID1基因CDS区全长654bp,编码217个氨基酸,白洗猪与山东莱芜猪、广西陆川猪PID1蛋白氨基酸同源性为98.2%与97.7%;进化树分析结果表明白洗猪与两个猪种间遗传关系相对较远,种间比对黄牛、牦牛、猕猴、小鼠、眼镜王蛇、人、原鸡、非洲爪蟾、大鼠和斑马鱼PID1蛋白氨基酸同源性依次为96.6%、96.6%、96.3%、95.0%、93.9%、91.7%、90.8%、88.2%、69.7%和67.3%;系统进化树分析表明PID1基因在多物种之间的进化高度保守,结构功能分析表明白洗猪PID1基因功能区主要是编码链氨基酸C端的PTB结构域。本研究成功克隆了白洗猪PID1基因,为探究其对白洗猪肌内脂肪沉积方面的影响及为白洗猪种资源开发利用奠定理论基础。
【作者单位】： 贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室;贵州省畜牧兽医学校;
【关键词】： 白洗猪 肉质 肌内脂肪 PID基因 克隆 PTB
【基金】：贵州省农业攻关项目(黔科合NY[2013]3071号);贵州省农业攻关项目(黔科合NY[2015]3008-1号)
【分类号】：S828.2
【正文快照】： 白洗猪是贵州省东南部一个优质地方猪种[1]。贵州白洗猪选育与产业化示范课题组研究发现,白洗猪不含氟烷基因[2],肌肉肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)为3.63%±0.91%,粗蛋白质为21.86%±1.62%,大理石纹为3.74±0.36,剪切力为2.74kg±0.17kg,必需氨基酸占总氨基酸含量的38.27%

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1 杨伦;徐正刚;王慧;陈其美;陈伟;胡艳霞;石元;祝洪磊;曾勇庆;;RNA干扰沉默PID1基因在C2C12细胞中表达的研究[J];山东大学学报(理学版);2013年01期

2 ;[J];;年期

，

本文编号：717834