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基于COⅠ基因序列的东、黄海区野生与养殖大黄鱼遗传多样性分析

发布时间:2017-08-24 04:04

  本文关键词:基于COⅠ基因序列的东、黄海区野生与养殖大黄鱼遗传多样性分析


  更多相关文章: 大黄鱼 COⅠ基因 遗传多样性 遗传分化 群体


【摘要】:为研究野生与养殖大黄鱼(Larimichthys crocea)群体的遗传多样性,对大黄鱼8个野生群体及6个养殖群体共336个样本的线粒体COⅠ基因部分序列进行了扩增和测序分析。实验最终获得序列片段长621 bp,总变异位点38个,简约信息位点23个,单变异位点15个,其中野生群体包含38个变异位点,占总变异的100%,养殖群体包含8个变异位点,占总变异的21.05%。在所有样本中共检测出单倍型34个,单倍型多样性为0.587,核苷酸多样性为0.00194,野生及养殖群体单倍型多样性指数分别为0.714~0.952、0.000~0.581。大黄鱼养殖与野生两个组群间的遗传分化指数为0.04982,占总变异的4.98%,差异极显著(P0.01),组群间群体间的变异占1.46%(P0.05),群体内的变异占93.56%(P0.01)。以上结果表明,大黄鱼的遗传变异主要来自于群体内,养殖群体的遗传多样性显著低于野生群体,两者的遗传多样性程度均处于较低水平,养殖群体间或野生群体间不存在显著的遗传分化,而养殖与野生两大组群间存在着显著的遗传分化。此外,通过对群体遗传结构及进化树的分析表明,东、黄海大黄鱼应属于同一地理种群,但两者间存在较低程度的遗传分化现象,黄海的大黄鱼群体遗传多样性高于东海群体。本研究可为大黄鱼种质资源的保护和恢复提供理论依据。
【作者单位】: 农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室中国水产科学研究院东海水产研究所;
【关键词】大黄鱼 COⅠ基因 遗传多样性 遗传分化 群体
【基金】:公益性行业(农业)科研专项(201303047) 中央级科研院所基本科研业务费项目(东2012T05) 水产种质资源平台(2014DKA30470)
【分类号】:S917.4
【正文快照】: 大黄鱼(Larimichthys crocea)隶属于鲈形目(Perciformes)、石首鱼科(Sciaenidae)、黄鱼属,俗称黄鱼、黄瓜鱼、黄花鱼等,为暖温性集群洄游性鱼类[1-2]。在中国南至雷州半岛,北达山东半岛的海域以及朝鲜西南部外海均有分布[3]。大黄鱼曾位居中国传统的“四大海产”之首,有“海水

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