基于cDNA-SCoT差异显示的甘蔗应答水分胁迫基因表达谱分析（英文）

发布时间：2017-09-02 01:43

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【摘要】：【目的】研究甘蔗应答水分胁迫差异基因表达,进一步探究甘蔗应答水分胁迫的分子机制,为开展甘蔗抗旱综合性遗传改良研究提供科学依据。【方法】选用GT11为材料,分别构建对照、干旱、复水3个处理总RNA混合池,使用cDNA-SCoT差异显示构建GT11伸长期应答水分胁迫的基因表达谱,筛选、分离TDFs进行测序,在NCBI数据库进行BLAST同源性检索,根据同源基因推测基因功能。【结果】通过42条SCoT引物筛选得到180个TDFs,有100个TDFs与NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,根据同源基因功能可分为14类:新陈代谢相关基因(11个)、能量代谢相关基因(12个)、运输途径相关基因(5个)、通信及信号转导相关基因(6个)、细胞循环及DNA加工相关基因(3个)、转录调控因子相关基因(3个)、蛋白质合成相关基因(17个)、蛋白质加工相关基因(1个)、结合功能蛋白相关基因(7个)、环境互作相关基因(3个)、转座子、毒性及质粒蛋白相关基因(5个)、细胞成分生物合成相关基因(1个)、防御相关基因(4个)和未知功能蛋白基因(22个)。【结论】甘蔗应答水分胁迫调节途径具有多样性、复杂性、协调性和网络性;应用cDNA-SCoT差异显示筛选获得水分胁迫相关TDFs,可为进一步研究甘蔗应答水分调控途径的分子机理提供重要信息。
【作者单位】： 广西农业科学院甘蔗研究所/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室;广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室;广西大学/广西亚热带生物资源保护和利用重点实验室;
【关键词】： 甘蔗 cDNA-SCoT 水分胁迫 复水 基因表达谱
【基金】：National Natural Science Foundation of China(31400281) Guangxi Natural Science Foundation(2014GXNSFAA118128) Basic Special Fund of Guangxi Academy of Agricultural Sciences(2015JZ11,2015JM24)
【分类号】：S566.1
【正文快照】： 0Introduction 【Research significance】0ver 80/0of sugarcane in China are planted in dry sloping fields without iirigating conditions,and yearly seasonal drought has become the main constraint factor on sugarcane production and sugar industry safety i

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本文编号：775672