基于线粒体COII-LrRNA基因对肾形肾状线虫种内群体的遗传多样性分析
本文关键词：基于线粒体COII-LrRNA基因对肾形肾状线虫种内群体的遗传多样性分析
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【摘要】：肾形肾状线虫(Rotylenchulus reniformis)是一种植物半内寄生线虫,分布于世界的热带和亚热带地区,是许多蔬菜和热带果树重要的病原线虫。为明确该线虫种内群体的遗传变异,本研究采用序列分析法,对采自浙江(ZJ)、福建(FJ)和重庆(CQ)3个地区的肾形肾状线虫的线粒体COII-Lr RNA基因序列进行比较。结果表明,肾形肾状线虫线粒体COII-Lr RNA基因片段序列为557~563 bp,AT含量为85.5%,明显高于GC含量。序列分析所得3个群体总的变异位点数、单倍型数、单倍型多样性指数(haplotype diversity,Hd)和核苷酸多样性指数(nucleotide diversity,π)分别为176、40、0.946和0.157 4。分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)结果显示,这3个肾形肾状线虫群体间遗传分化系数为0.058 15,遗传分化程度中等,没有明显的地理隔离。遗传变异结果显示,94.18%的变异来自群体内个体间,只有5.82%的变异发生在群体间。结果说明,我国肾形肾状线虫种群内COII-Lr RNA基因序列变异较明显,具有丰富的遗传多样性,且对环境变化的适应能力较强。研究结果丰富了我国肾形肾状线虫的系统发育信息,为肾形肾状线虫危害植物的内在遗传因素的研究提供了资料。
【作者单位】： 浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所;苏州出入境检验检疫局;
【关键词】： 肾形肾状线虫 线粒体DNA(mtDNA) COII-LrRNA基因 遗传多样性
【基金】：国家自然科学基金(No.31371921) 国家重点基础研究发展计划(973计划)(No.2013CB127501)
【分类号】：S432.45
【正文快照】： 肾形线虫属(Rotylenchulus)是一种植物半内寄生线虫,通常分布于热带和亚热带地区,目前属内有10个有效种,而国内已报道的有肾形肾状线虫(R.reniformis)和北方贝肾状线虫(R.borealis)两种(张燕,2010)。肾形肾状线虫是其中分布和危害最广泛的一种,其寄主植物多达300余种,主要包括
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本文编号：781570
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