烟草抗番茄斑萎病毒基因筛选与生物信息学分析
本文关键词:烟草抗番茄斑萎病毒基因筛选与生物信息学分析
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【摘要】:通过同源克隆的方法在TSWV高感烟草品种NC89、TSWV耐病烟草品种中烟100中分别克隆出一个疑似抗番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)的基因,分别命名为NtSw-5~(NC89)和NtSw-5~(zy100)。序列分析表明,NtSw-5~(NC89)长3819bp,包含1个完整的读码框,编码1273个氨基酸,理论等电点和相对分子质量分别为5.64和147529.5Da;NtSw-5~(zy100)长3165bp,包含1个完整的读码框,编码1054个氨基酸,理论等电点和相对分子质量分别为6.75和122032.9Da;NtSw-5~(NC89)和NtSw-5~(zy100)均不含信号肽,均无明显跨膜区,二者均含有大多数植物抗性蛋白所共有的CC-(NB-ARC)-LRR典型结构。系统进化树分析表明,NtSw-5~(NC89)与马铃薯假定晚疫病抗性蛋白同源R1A-3近源关系最近,NtSw-5~(zy100)与烟草假定晚疫病抗性蛋白同源R1A-3同型X2近源关系最近。该结果可为烟草番茄斑萎病毒抗性研究和烟草番茄斑萎病毒的防治提供理论基础。
【作者单位】: 中国农业科学院烟草研究所烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室;北京科技大学化学与生物工程学院;甘肃省烟草公司庆阳市公司;云南烟草保山香料烟有限责任公司;
【关键词】: 烟草 番茄斑萎病毒 抗性基因 生物信息学分析
【基金】:国家烟草专卖局科技创新平台项目“烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室专项经费”(023201305) 云南省烟草公司科技项目“德宏绿色生态优质烟叶生产技术研究及应用”(2013YN37)
【分类号】:S435.72
【正文快照】: 近年来,随着农业产业结构的调整以及全球农副产品贸易的频繁,造成众多植物病毒及其媒介昆虫的全球传播和蔓延。番茄斑萎病毒(Tomatospotted wilt virus,TSWV)正是在这种情况下,随其虫媒介体蓟马(Thrip)进入我国,在我国烟草种植区猖獗危害[1]。种植抗病品种是防治番茄斑萎病最
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,本文编号:782189
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