普通烟草LBD基因家族的全基因组序列鉴定与表达分析

发布时间：2017-09-04 17:16

  本文关键词：普通烟草LBD基因家族的全基因组序列鉴定与表达分析

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【摘要】：LBD是一类具有LOB(lateral organ boundaries)结构域的基因家族,在植物发育过程中起到非常重要的作用。采用生物信息学方法,根据拟南芥LBD基因序列鉴定了普通烟草基因组中的LBD基因,并对家族成员进行了序列特征、系统发育和表达谱分析。结果表明:普通烟草基因组中共有98个LBD基因成员,其基因结构相对简单,一般含有1~3个外显子。LBD基因家族可分成I和II两大类,两类均含有CX_2CX_6CX_3C保守结构域,但II类不含有LX_6LX_3LX_6L形成的"卷曲螺旋"二级结构,根据与拟南芥LBD蛋白构建的系统发育树则可细分成5个亚家族(Ia、Ib、Ic、Id和II)。将LBD基因与表达序列标签(EST)比对,发现36个基因有EST证据;EST、芯片数据和转录组数据分析表明:LBD基因具有不同的组织表达模式,部分基因表现出组织特异性。这些研究结果为普通烟草LBD基因家族功能的深入研究奠定了基础。
【作者单位】： 中国农业科学院烟草研究所/烟草行业烟草基因资源利用重点实验室;华中农业大学园艺林学学院;
【关键词】： 普通烟草 LBD基因家族 系统进化 基因表达
【基金】：国家高技术研究发展计划(“863”计划)项目(2012AA021801)
【分类号】：S572
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160128.1532.022.htmlLBD(LATERAL ORGAN BOUNDARIES DO-MAIN)基因是一类具有LOB(lateral organ bounda-ries)结构域的植物特有的转录因子基因家族。该类基因家族在调控植物侧生器官发育、协同激素调控植物发育、调控植物氮

【共引文献】

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本文编号：792800