βB2基因敲除小鼠睾丸组织长链非编码RNA的差异性表达分析
本文关键词:βB2基因敲除小鼠睾丸组织长链非编码RNA的差异性表达分析
更多相关文章: lncRNA βB晶体蛋白 睾丸发育 Prx
【摘要】:目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在βB2基因敲除小鼠睾丸中的表达及其影响睾丸发育的可能机制。方法采用lncRNA芯片技术,筛选野生型(WT)和βB2基因敲除(KO)小鼠睾丸组织(均n=3)中lncRNA及信使RNA(mRNA)表达谱的变化;对差异表达lncRNA和mRNA进行GO数据库分析及KEGG数据库分析,建立调控网络图;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达的lncRNA和mRNA,探讨调控通路。结果 (1)两组小鼠睾丸组织差异表达的lncRNA共140条,mRNA共477条;(2)通过GO数据库分析,筛选出差异表达lncRNA共12条,其中上调7条,下调5条;(3)经KEGG数据库进行路径分析,发现差异表达mRNA主要经由Ca2+信号、配体-受体相互作用等信号通路起作用;(4)用关联矩阵法建立了lncRNA和mRNA共表达网络图,共有17个节点,12条连接,包含9条lncRNA和8条mRNA;其中Rsl1由3条lncRNA调控,Lpo和Mpo各由2条lncRNA调控,Hdac1、Ephb4等各由1条lncRNA调控。(5)qRT-PCR分析结果表明,在βB2基因敲除小鼠睾丸组织中,lncRNA A-30-P01019163和P2rx7的表达均下调(P0.05)。结论 lncRNA与βB2基因的晶状体外功能密切相关,其中lncRNA A-30-P01019163可能通过调控下游P2rx7mRNA的表达影响睾丸组织细胞周期及信号转导,进而调控睾丸发育。
【作者单位】: 第二军医大学长海医院实验诊断科;第二军医大学长海医院妇产科;
【关键词】: lncRNA βB晶体蛋白 睾丸发育 Prx
【基金】:国家自然科学基金(81170834,81571387,81300748)~~
【分类号】:R339.21
【正文快照】: [Acad J Sec Mil Med Univ,2016,37(1):59-64]βB2晶体蛋白(βB2crystallin,CRYBB2)主要在晶状体表达,对维持晶状体的屈光度及透明性起重要作用。有研究发现βB2基因敲除(KO)会引起年龄相关性白内障的发生[1]。除了晶状体外,CRYBB2还能在晶状体外表达并具有重要功能,如可在视
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,本文编号:806486
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