地黄环烯醚萜合成后修饰相关基因的挖掘与分析

发布时间：2017-09-08 20:34

  本文关键词：地黄环烯醚萜合成后修饰相关基因的挖掘与分析

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【摘要】：本研究采用Illumina Hi Seq 2500技术对地黄脱毒苗进行转录组测序,获得了地黄转录组信息,并对构建好的地黄基因Unigene库进行蛋白功能注释、KEGG代谢通路分析等生物信息学分析,以期大规模挖掘与地黄环烯醚萜类成分生物合成及后修饰相关的基因。应用高通量测序技术对地黄组培苗进行转录组测序,得到13.61Gb的干净数据,De novo组装后共获得70778条Unigene,其中33.428(47.23%)条unigenes能被Nr、Swiss-Prot、Pfam、KOG、KEGG、GO和COG等公共数据库注释。进一步对被注释的地黄萜类生物合成及后修饰相关基因进行挖掘发现,地黄转录组中共有81个Unigene参与萜类骨架合成;共有226个Unigene可能参与CYP450介导的环烯醚萜骨架的氧化修饰;共有102个Unigene与糖基转移酶相关。地黄转录组数据库的获得为探索地黄环烯醚萜类成分的生物合成研究奠定了基础,为后续基因功能的分析等研究提供分子水平依据。
【作者单位】： 河南中医学院药学院河南中医学院呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心;
【关键词】： 转录组 地黄 细胞色素氧化酶p 糖基转移酶
【基金】：国家自然科学基金项目(81603232) 国家“十二五”科技支撑计划项目(2011BAl06802) 河南省高等学校重点科研项目计划(15A360036) 河南中医学院博士科研基金(BSJJ2011-07) 社会发展领域河南科技攻关计划项目(122101310400)
【分类号】：S567.234
【正文快照】： 地黄(Rehmannia glutinosa Libosch.ex Fisch)为玄参科(Scrophulariaceae)多年生草本植物,块根及其加工品分别作为鲜地黄、生地黄和熟地黄入药,为历代中医常用中药。环烯醚萜类化学成分是地黄发挥疗效的主要物质基础。环烯醚萜属于臭乙二醛的缩醛衍生物,在植物体内常以与糖形，

本文编号：816192