基于目标基因芯片数据预测lncRNAs调控脑缺血再灌注损伤后的作用效应

发布时间：2017-09-08 21:48

  本文关键词：基于目标基因芯片数据预测lncRNAs调控脑缺血再灌注损伤后的作用效应

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【摘要】：长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)在细胞中有重要调控作用。已有研究报道,脑缺血再灌注损伤可诱导大量lncRNAs表达水平的改变,然而其具体作用机理未知。现从GEO数据库中下载基因芯片数据,分析损伤后脑组织中lncRNAs和mRNAs的表达改变。结果显示27条lncRNAs和408条mRNAs表达上调,9条lncRNAs和31条mRNAs表达下调。同时,基因本体论和通路富集分析显示差异表达的转录本在免疫和炎症反应、细胞凋亡调控等生物过程及相关通路显著富集。此外,基于lncRNAs目标预测程序和lncRNAs-mRNAs共调控网络,对序列数据和表达数据进行综合分析,发现差异表达lncRNAs参与调控细胞凋亡、免疫和炎症反应,并推测出linc RNA(chr1 9:5771 425-5848475_F)、lincRNA(chr1:1 37503023-1 37625604_R)和lincRNA(chr1 4:21 029450-21 049451_F)等lncRNAs潜在的靶基因和调控机制。这些发现提示lncRNAs广泛参与调控脑缺血再灌注损伤,为缺血性脑卒中损伤机制和治疗方案提供新的研究方向。
【作者单位】： 南京医科大学第一临床医学院;南京医科大学基础医学院;
【关键词】： 脑缺血 长链非编码RNA 免疫反应 炎症反应 生物信息学预测 基因芯片数据 GEO数据库
【基金】：国家大学生创新创业训练计划项目(201310312015Z)
【分类号】：R743.3
【正文快照】： 脑卒中是威胁人类健康的重大疾病之一。根据病因,脑卒中可分为缺血性和出血性两种类型,其中缺血性脑卒中约占脑卒中病人总数的60%~80%。缺血性脑卒中开始于大脑动脉的堵塞,缺血区在低氧低糖的情况下能量代谢发生改变,导致细胞离子平衡紊乱、酸中毒、炎症反应等一系列事件的发，

本文编号：816521