HBV病毒S基因及C基因突变研究

发布时间：2017-09-09 04:45

  本文关键词：HBV病毒S基因及C基因突变研究

  更多相关文章： 乙型肝炎病毒 疫苗保护失败 儿童病例 病毒变异

【摘要】：目的:研究乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)疫苗免疫保护失败的儿童患者体内病毒表面抗原基因(Surface gene),其a决定簇(a determinant)和主要亲水区(Major Hydrophilic Region,MHR)区段的变异情况,并结合与未接种疫苗的儿童患者体内病毒表面抗原及基因a决定簇和主要亲水区段的变异情况,比较不同组别之间的突变差异。方法:收集重庆地区乙型肝炎病毒疫苗免疫保护失败患儿(243例)及未接种疫苗的乙型肝炎病毒感染患儿(20例)血清样本,从样本血清中提取HBV病毒DNA,用巢氏PCR方法扩增HBV病毒的S基因区段,利用Sanger测序,得到不同患者体内的HBV S基因序列,利用HBV分型工具对所得序列进行基因型分析,然后将序列与相应基因型的标准序列进行比对分析,分析不同组中各位点的突变情况。结果:243例免疫保护失败患儿体内病毒a决定簇突变检出率显著高于20例未经疫苗免疫组患儿(31.7%vs 10%,P=0.044);免疫失败组儿童体内病毒MHR突变率数值也高于未接种组儿童,在统计学上差异不显著(49.8%vs 30%,P=0.106)。在疫苗免疫保护失败儿童组中,a决定簇和MHR区段的核苷酸突变的发生与病毒低水平复制显著相关:与各基因型野生型相比,突变组儿童的DNA滴度显著低于野生表型组儿童(log10 6.9±1.8 vs log10 7.7±1.8,P=0.000;log10 7.1±1.6 vs log10 7.6±1.9,P=0.000)。免疫失败儿童病例中,MHR突变组儿童谷丙转氨酶(Alanine aminotransferase,ALT)数值也显著高于未突变组(67.1±58.8 vs 56.5±51.8,P=0.018)。在243例疫苗免疫保护失败儿童体内病毒MHR区域中共检出145个变异氨基酸,热点变异类型主要包括I110L(6例)、K122R(15例)、T126A(18例)、I126T(14例)、M133L(7例)、G145R(6例)及Y161F(12例)等。进一步分析各类型突变与临床表型间差异,发现含G145R及Y161F突变病例体内血清病毒DNA水平显著低于无突变组(log106.8±1.1 vs log10 7.5±1.8,P=0.048;log10 5.0±2.6 vs log10 7.3±1.8,P=0.000)。结论:疫苗免疫保护失败儿童病例体内病毒a决定簇及MHR具有较高的突变率,且该区段的突变与病毒较低的复制水平及及较高的ALT相关。
【关键词】：乙型肝炎病毒 疫苗保护失败 儿童病例 病毒变异
【学位授予单位】：重庆医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R725.1
【目录】：

• 英汉缩略语名词对照5-6
• 中文摘要6-8
• 英文摘要8-10
• 前言10-11
• 第一部分 重庆地区乙肝疫苗免疫无效儿童病毒基因组表面抗原区变异研究11-25
• 1 材料与仪器11-12
• 1.1 实验研究病例对象的收集11
• 1.2 主要仪器设备及试剂11-12
• 2 方法12-16
• 2.1 样品的收集与处理12
• 2.2 HBV血清标志物、ALT及DNA载量检测12-13
• 2.3 样本血清中HBV DNA的提取13
• 2.4 HBV S基因区序列的扩增13-14
• 2.5 HBV S基因区序列测定14
• 2.6 测序结果数据分析14-16
• 3 结果16-21
• 3.1 慢性HBV感染患者基本临床资料16-17
• 3.2 HBV S基因区突变分析17-18
• 3.3 MHR热点突变氨基酸位点及突变类型18-19
• 3.4 MHR及a决定簇氨基酸突变与临床资料间相关性分析19-21
• 4 讨论21-22
• 小结22-23
• 参考文献23-25
• 第二部分 儿童与成人慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒Core基因区准种特征及正选择压力差异分析25-41
• 1 材料25-26
• 1.1 数据材料来源25
• 1.2 主要仪器设备及试剂25-26
• 2 方法26-30
• 2.1 样品的收集与处理26
• 2.2 HBV血清标志物、ALT及DNA载量检测26
• 2.3 样本血清中HBV DNA的提取26-27
• 2.4 巢氏PCR扩增HBV C基因区27-28
• 2.5 HBV C基因区序列测定28
• 2.6 HBV基因分型28
• 2.7 测序结果比对分析28-30
• 3 结果30-35
• 3.1 慢性HBV感染患者基本临床资料30-31
• 3.2 儿童和成人HBV慢性感染病例Core基因区异质性分析31-32
• 3.3 不同病例群体体内病毒Core基因区正选择位点统计32-34
• 3.4 不同病人群体体内HBV Core基因区正选择位点免疫表位特性分析34-35
• 4 讨论35-37
• 小结37-38
• 参考文献38-41
• 文献综述41-45
• 参考文献43-45
• 致谢45-46
• 攻读学位期间撰写和发表的论文46

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 闻玉梅;;乙型肝炎病毒分子生物学国际会议[J];国外医学(微生物学分册);2003年05期

2 洪卫国,金磊,刘士敬,王福生;乙型肝炎病毒在家庭内感染的调查[J];中华实验和临床病毒学杂志;2004年04期

3 何淼;;乙型肝炎病毒的“冤、假、错”案[J];肝博士;2006年01期

4 姜恩荣;;乙型肝炎病毒宫内传播的研究[J];职业与健康;2008年03期

5 宗敏;闫香芹;侯春生;张岩;;乙型肝炎病毒的夫妻间传播及其预防的研究[J];中华实验和临床感染病杂志(电子版);2008年02期

6 祝成亮;李艳;汪明;高国生;;乙型肝炎病毒对胰岛素样生长因子结合蛋白3表达的影响[J];国际检验医学杂志;2013年22期

7 邓远运;;乙型肝炎病毒[J];国外医学(微生物学分册);1979年04期

8 易健如;何南祥;郭茂福;;肝外细胞中的乙型肝炎病毒[J];国外医学.流行病学传染病学分册;1984年04期

9 邱长斌;王勇雄;邱传禄;;乙型肝炎病毒免疫复合物性肾小球肾炎的研究近况(二)——临床、病理与防治措施[J];国外医学(内科学分册);1988年01期

10 庄辉;;关于可能存在乙型肝炎病毒Ⅱ型的研究[J];国外医学.流行病学传染病学分册;1988年05期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 任鹏;;乙型肝炎病毒变异研究进展[A];第五次全国中青年检验医学学术会议论文汇编[C];2006年

2 杨兵;张莉萍;文阳安;黄世峰;;乙型肝炎病毒X蛋白稳定表达株的构建及沉默效果观察[A];中华医学会第九次全国检验医学学术会议暨中国医院协会临床检验管理专业委员会第六届全国临床检验实验室管理学术会议论文汇编[C];2011年

3 夏伟良;沈岩;谢海洋;吴李鸣;陈瑜;郑树森;;环孢素A对乙型肝炎病毒作用的体外实验[A];2005年浙江省感染病、肝病学术会议论文汇编[C];2005年

4 孙庆丰;王文冰;徐道振;李蕴铷;丁继光;;乙型肝炎病毒e抗原阴性的慢性乙型重型肝炎[A];2006年浙江省感染病、肝病学术会议论文汇编[C];2006年

5 何芳;唐红;刘丽;王u&;刘凤君;周陶友;赵连三;刘聪;;丙型肝炎病毒核心蛋白抑制乙型肝炎病毒转录与复制的实验研究[A];第五届全国肝脏疾病临床暨中华肝脏病杂志成立十周年学术会议论文汇编[C];2006年

6 成军;;乙型肝炎病毒耐药的研究进展[A];第三届全国重型肝病及人工肝血液净化学术年会论文集（上册）[C];2007年

7 成军;;加强乙型肝炎病毒耐药的认识和监测[A];第一届全国疑难重型肝病大会、第四届全国人工肝及血液净化学术年会论文集[C];2008年

8 黄圆;罗依;谭亚敏;韩晓雁;朱晓黎;施继敏;谢万灼;黄河;;异基因造血干细胞移植中乙型肝炎病毒再激活的临床研究[A];第七届全国血液免疫学学术大会暨2008年浙江省血液病学术年会论文汇编[C];2008年

9 杨建功;黄兵;钱健帮;何小峰;;乙型肝炎病毒e抗原阴性慢性乙型肝炎预后的临床分析[A];第6届全国疑难及重症肝病大会论文集[C];2011年

10 傅佳鹏;吴其恺;王平;李炜;李晓良;邓欣;;164例乙型肝炎病毒耐药病例耐药位点的分析[A];第二十次全国中西医结合肝病学术会议论文汇编[C];2011年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 冯卫东;乙型肝炎病毒结构图绘制成功[N];科技日报;2008年

2 石家庄市第五医院妇产科副主任、副主任医师 朱宝申;浅谈乙型肝炎病毒的父婴传播[N];石家庄日报;2009年

3 北京大学基础医学院微生物学教研室教授 庄辉;单项抗-HBc阳性说明……[N];健康报;2001年

4 黄显斌 唐明山;乙肝病毒基因组研究记录被刷新[N];中国医药报;2003年

5 记者　徐可　通讯员　黄显斌、唐明山;乙肝病毒基因组新编码基因首次成功破译[N];光明日报;2003年

6 成君;慢性乙肝患者不能只顾降酶[N];家庭医生报;2006年

7 ;我国成功破译乙肝病毒基因组新编码基因[N];中国高新技术产业导报;2003年

8 中国肝炎基金会;乙肝感染途径[N];农民日报;2001年

9 蔡fg东;治疗前的评估和咨询非常必要[N];中国医药报;2012年

10 本报记者 黄显斌 唐明山;乙肝病毒新编码基因被破译[N];科技日报;2003年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 范吉云;乙型肝炎病毒耐药相关突变及新突变的研究[D];上海交通大学;2013年

2 林晓倩;巨细胞病毒和乙型肝炎病毒围产感染的临床研究[D];南京大学;2016年

3 李爽;乙型肝炎病毒对细胞色素P450同工酶3A4表达的影响[D];第二军医大学;2006年

4 周福平;乙型肝炎病毒慢性感染对细胞色素P450 2C9表达的影响[D];第二军医大学;2008年

5 李金成;健康成人乙型肝炎病毒疫苗接种后无应答者免疫功能研究[D];中南大学;2009年

6 李维娜;乙型肝炎病毒编码蛋白对宿主炎性基因的调控作用及其机制研究[D];华中科技大学;2011年

7 赵震环;蝎活性多肽Mucroporin-M1激活MAPK通路抑制HBV复制研究[D];武汉大学;2012年

8 于士颜;乙型肝炎病毒多聚酶抑制Ⅰ型干扰素诱生机制的研究[D];复旦大学;2011年

9 赵文亮;乙型肝炎病毒基因突变检测与分析平台研发[D];第四军医大学;2014年

10 李伯安;乙型肝炎病毒e抗原相互作用蛋白基因的克隆化及功能的初步研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2004年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 薛颖莹;乙型肝炎病毒相关性IgA肾病临床病理特点和预后的研究[D];福建医科大学;2015年

2 万静芳;他克莫司治疗乙型肝炎病毒相关性膜性肾病的随机对照临床试验[D];第三军医大学;2015年

3 张婷玉;乙型肝炎病毒中国流行株C基因型稳定转染细胞模型的评价与应用[D];河南中医学院;2015年

4 徐庆国;乙型肝炎病毒X基因亚型EHBH2在原发性肝癌进程中的作用及临床意义研究[D];第二军医大学;2015年

5 丁晓琳;乙型肝炎病毒基因型及其核心启动子/前核心区变异的研究[D];安徽医科大学;2014年

6 周率;Rituximab联合化疗治疗的NHL患者中乙型肝炎病毒再激活风险的Meta分析[D];华东师范大学;2015年

7 陈默;天然药物KY-03分离抗HBV有效成分的研究[D];北京工业大学;2015年

8 袁松松;乙型肝炎病毒e抗原在HBV感染过程中作用机制的研究[D];南昌大学医学院;2015年

9 郑亢;IL-10受体基因多态性与慢性HBV感染的遗传易感性研究[D];安徽医科大学;2015年

10 魏振宏;质粒用于乙型肝炎病毒DNA定量检测室内质量控制的效果评价[D];兰州大学;2016年

，

本文编号：818380