家兔ANGPTL4基因与家兔生长性状关联分析

发布时间：2017-09-13 12:06

  本文关键词：家兔ANGPTL4基因与家兔生长性状关联分析

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【摘要】：血管生成素样蛋白4(Angiopoietin-like protein 4, ANGPTL4)类血管生成素基因是与脂肪代谢相关的分泌蛋白,而且ANGPTL4基因不仅调节脂肪和能量代谢,还参与到细胞增殖和凋亡调控以及控制肌肉生长过程,由此在肌肉生长发育过程中发挥着重要的作用。本试验选取天府黑兔、伊拉兔和新西兰兔为试验材料,通过PCR产物直接测序法检测ANGPTL4基因编码区SNPs位点,通过连锁不平衡分析和PCR-RFLP技术对遗传突变位点进行基因分型,并将SNPs位点与家兔生长性状进行相关性分析。主要结果如下：1.通过对天府黑兔、新西兰兔和伊拉兔三个品种在35、70和84日龄的生长性状进行比较后,结果表明三个品种之间差异不显著,但是多重比较表明天府黑兔在70日龄和84日龄体重显著高于伊拉兔(P0.05)；新西兰兔在28日龄体重显著高于伊拉兔(P0.05),并且在35日龄体重高于其它品种；新西兰兔在70、84日龄体重均高于伊拉兔。不同家兔品种之间在28-84日龄平均日增重差异不显著,但天府黑兔平均日增重高于新西兰兔和伊拉兔；新西兰兔高于伊拉兔。2.在ANGPTL4基因外显子6中共检测出3个SNP位点,其中一个为错义突变,其它两个是同义突变,分别为：c.827 GA、c.867 TC和c.975 TC。通过SMART在线分析软件预测蛋白质结构域发现这三个位点均位于FBG结构域上。然后通过连锁不平衡分析表明c.827 GA与其它两个SNPs位点高度连锁(r20.75),由此可以选择c.827 GA位点作为遗传效应分析位点,进行后续基因多态性研究。3.在3个家兔品种群体内,对c.827 GA位点进行基因分型,检测到三个家兔群体内AA、AG和GG三种基因型,均为中度多态(0.25PIC0.50)；χ2检验表明c.827 GA位点在三个家兔群体内处于Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。4. ANGPTL4基因的c.827 GA位点与生长性状关联分析表明在三个品种中,c.827 GA在70、84日龄体重和28-84日龄平均日增重的遗传效应达到显著水平(P0.05)。其中,GG基因型个体70、84日龄体重以及28-84日龄平均日增重均显著高于AA基因型个体(P0.05),高于AG基因型个体；GG基因型个体28日龄、35日龄体重高于AA和AG型个体。
【关键词】：家兔 ANGPTL4 生长性状 关联性分析
【学位授予单位】：四川农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S829.1
【目录】：

• 摘要5-6
• ABSTRACT6-10
• 1 文献综述10-17
• 1.1 概述10-11
• 1.2 ANGPTLs家族11-12
• 1.3 ANGPTL4基因研究进展12-15
• 1.3.1 发现及命名12-13
• 1.3.2 结构与功能13
• 1.3.3 与脂代谢相关研究13-15
• 1.4 候选基因法15-17
• 1.4.1 分子遗传标记15-16
• 1.4.2 PCR-RFLP技术16-17
• 1.5 试验目的及主要内容17
• 1.5.1 试验目的17
• 1.5.2 试验主要内容17
• 2 材料与方法17-25
• 2.1 试验材料17-18
• 2.2 主要仪器及试剂18-19
• 2.2.1 主要实验仪器18
• 2.2.2 主要试剂及试剂配制18-19
• 2.2.3 主要器械消毒及清洗处理19
• 2.3 试验方法19-21
• 2.3.1 家兔生长性状测定19-20
• 2.3.2 总RNA提取20
• 2.3.3 总RNA检测20-21
• 2.3.4 cDNA的合成21
• 2.4 基因组DNA提取及检测21-22
• 2.4.1 基因组DNA提取21
• 2.4.2 检测DNA质量21-22
• 2.5 SNPs位点检测22-24
• 2.5.1 特异性引物设计22
• 2.5.2 编码区SNP位点检测22-23
• 2.5.3 PCR-RFLP酶切分型23-24
• 2.6 数据分析处理24-25
• 2.6.1 数据处理24-25
• 2.6.2 试验分析软件25
• 3 结果分析25-31
• 3.1 比较分析不同家兔品种的生长性状25-26
• 3.2 DNA提取结果26
• 3.3 SNPs位点的检测26-28
• 3.4 候选SNP位点的筛选28-29
• 3.5 ANGPTL4基因遗传效应分析29-31
• 3.5.1 c.827 G>A位点基因型和等位基因频率29
• 3.5.2 ANGPTL4基因多态性分析29-30
• 3.5.3 c.827 G>A位点与家兔生长性状的关联性分析30-31
• 4 讨论31-35
• 4.1 PCR反应体系条件优化分析31-32
• 4.2 不同家兔品种的生长性状分析32-33
• 4.3 ANGPTL4基因遗传多态性分析33-34
• 4.4 ANGPTL4基因与家兔生长性状相关性分析34-35
• 5 结论35-36
• 参考文献36-42
• 致谢42

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

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本文编号：843605