杨树磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析

发布时间：2017-09-16 08:45

  本文关键词：杨树磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析

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【摘要】：为了对已测序杨树Populus trichocarpa Torr.Gray中磷酸肌醇特异性磷脂酶C(phosphoinositidespecific phospholipase C,PI-PLC)家族基因进行系统分析,利用杨树基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定杨树PI-PLC家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过蛋白序列比对进行进化和分类分析。结果表明,杨树中含有7个PI-PLC家族基因,含有8~10个外显子,分布于杨树的4条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,杨树PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域。蛋白质进化树分析结果表明PI-PLC可分为2个亚家族。
【作者单位】： 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心;农业基因资源与生物技术北京市重点实验室;
【关键词】： 磷酸肌醇特异性磷脂酶C 杨树 进化分析 基因家族
【基金】：国家高技术研究发展计划(863)项目(2013AA102702) 国家自然科学基金(31270593) 北京市自然科学基金(6163028) 北京市农林科学院青年科研基金(QNJJ201416)
【分类号】：S792.11
【正文快照】： 磷酸肌醇特异性磷脂酶C(phosphoinositide-specific phospholipase C,PI-PLC)是一类水解磷脂的酶类,其水解4,5-二磷酸磷脂酰肌醇(PIP2),产生1,4,5-三磷酸肌醇(IP3)和1,2-二酰甘油(DAG)[1]。植物细胞中,水溶性IP3进入细胞质后在一系列磷酸激酶的作用下可以迅速转化为IP6,促进细

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本文编号：862050