扶绥县肝癌高发区HBV流行株基因参照序列建立

发布时间：2017-09-16 07:23

  本文关键词：扶绥县肝癌高发区HBV流行株基因参照序列建立

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【摘要】：目的建立广西扶绥县乙型肝炎病毒(HBV)流行株Pre-S、S、Pre-C/BCP基因参照序列。方法选取2013年扶绥县乙肝慢性携带者(As C)89例,测定其Pre-S、S、Pre-C/BCP基因,采用同源性分析等方法确定基因型,并按基因型在MEGA软件中进行序列比对,建立参照序列。结果扶绥县参照序列与Gen Bank收录的中国其他地区同基因型HBV序列(CDQ448627、EU439006)相比差异较大,最高可达2.07%;扶绥县不同基因型间参照序列的差异程度大于不同地区同基因型序列间的差异,最小为2.87%,最大者可达9.65%。结论初步建立扶绥县HBV流行株Pre-S、S、Pre-C/BCP基因参照序列,为扶绥县HBV基因突变的研究奠定基础。
【作者单位】： 广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部;
【关键词】： 乙型肝炎病毒 Pre-S基因 S基因 Pre-C/BCP基因 参照序列
【基金】：国家自然科学基金(81260319) 广西高校科技项目(2013ZD016)
【分类号】：R512.62
【正文快照】： 乙型肝炎的流行是全球范围内面临的一个重大公共卫生问题。全球有超过20亿的人口曾经感染过乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV),其中慢性HBV感染者大约4亿,占世界人口总数的5%[1-2]。HBV DNA的复制是以mRNA为中间体进行逆转录,再反转录为DNA进行复制。由于缺乏校对功能,在逆

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本文编号：861664